More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2099 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  100 
 
 		 176 aa  361  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  94.89 
 
 		 176 aa  349  1e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  45.81 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  41.52 
 
 		 178 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  40.94 
 
 		 178 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  43.84 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  40.23 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  41.04 
 
 		 179 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  40.11 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  43.15 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  43.15 
 
 		 184 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  42.47 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  40.82 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  33.14 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  40.82 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  36.24 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  35.51 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  32.24 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  32.19 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  32.19 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  34.9 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  32.41 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  35.24 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  37.62 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  32.35 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  25.38 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  28.68 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  29.59 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  32.41 
 
 		 192 aa  62  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  28.36 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  35.24 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  41.38 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  32.11 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  25.96 
 
 		 466 aa  58.5  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  32.48 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  32.84 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  38.78 
 
 		 515 aa  58.2  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  33.67 
 
 		 568 aa  57.4  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  31.82 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  29.73 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  33.65 
 
 		 518 aa  56.6  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  31.82 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  31.19 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  31.19 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  28.43 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  30.3 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  25.17 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  26.02 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  29.46 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  28.26 
 
 		 520 aa  54.7  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  23.53 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  27.1 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  28.3 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  30.95 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  28.43 
 
 		 444 aa  54.3  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  30.53 
 
 		 326 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  32.67 
 
 		 301 aa  53.9  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  32.58 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  29.7 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  26.73 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  30.48 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  24.22 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  34.69 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  33.67 
 
 		 475 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  26.73 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  26.92 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  27.36 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  35.23 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  27.64 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  27.18 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  29.59 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  29.25 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  30 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  31.36 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  29.47 
 
 		 326 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  29.47 
 
 		 326 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  29.47 
 
 		 326 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  30.83 
 
 		 158 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  29.47 
 
 		 326 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  32.61 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  24.41 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  33.33 
 
 		 342 aa  51.6  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  26.4 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  29.76 
 
 		 326 aa  51.2  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  28.43 
 
 		 161 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.47 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  29.41 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  28.57 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  51.2  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0995  putative CheW protein  31.73 
 
 		 146 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1838  CheW protein  24.62 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00299326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.41 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  31 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  24.75 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  33.33 
 
 		 328 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  31.82 
 
 		 344 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  28.8 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1325  CheW protein  32.29 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  29.46 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0324  CheW protein  26.21 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>