More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0129 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  100 
 
 		 178 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  35.26 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  35.63 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  35.26 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  33.9 
 
 		 181 aa  107  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  31.58 
 
 		 181 aa  103  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  34.13 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  35.5 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  29.38 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  34.32 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  34.32 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  34.32 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  27.38 
 
 		 176 aa  91.7  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  27.38 
 
 		 176 aa  91.7  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  32.32 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  35.51 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  31.4 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  33.12 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  33.86 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  27.65 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  30.77 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  26.47 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  29.84 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  26.57 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  31.03 
 
 		 518 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  34.41 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  33.33 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  34.41 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  25.19 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.44 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  30.89 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  34.12 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  37.93 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  24.44 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  24.44 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  32.32 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  24.44 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  25.38 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  29.79 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  32.22 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  24.06 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  30.07 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  25.74 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  25.74 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  26.32 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  25.47 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.19 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  27.01 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  27.07 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  27.78 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  26.97 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  27.66 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  28.26 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  25 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  23.7 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  28.16 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  23.7 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  23.7 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  22.56 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  34.52 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  25 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  34.52 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  26.05 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  36.36 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  29.35 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  27.21 
 
 		 515 aa  55.5  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  28.78 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  30.11 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  24.62 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  29.79 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  34.62 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  32.73 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.71 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  37.93 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  24.81 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  33.94 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.81 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  33.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  33.94 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  25.93 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  24.81 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  24.81 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  24.81 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4384  response regulator receiver modulated CheW protein  33.64 
 
 		 299 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.234409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  33.33 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  29.36 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  34.94 
 
 		 306 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  24.81 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  34.94 
 
 		 306 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  34.94 
 
 		 306 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  30.61 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  27.97 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  25.17 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  34.94 
 
 		 306 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  34.94 
 
 		 306 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  34.94 
 
 		 306 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  28.12 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  28.12 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  36.99 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  34.94 
 
 		 306 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>