166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3690 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  100 
 
 		 168 aa  326  8e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  46.11 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  43.79 
 
 		 181 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  43.2 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  43.45 
 
 		 181 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  38.18 
 
 		 180 aa  110  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  36.53 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  41.32 
 
 		 182 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  40.48 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  39.31 
 
 		 177 aa  101  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  40.49 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  36.78 
 
 		 176 aa  94.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  38.82 
 
 		 175 aa  94.7  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  38.24 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  34.29 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  35.63 
 
 		 176 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  37.65 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  38.92 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  37.06 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  38.32 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  33.83 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  37.78 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  37.36 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  29.93 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  30.36 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  28.69 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  29.12 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  27.66 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  30.56 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  25.35 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  29.37 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  29.37 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  35.16 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  28.67 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  25.17 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  36.26 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  30.56 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  30.56 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  30.56 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  25 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  24.31 
 
 		 306 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  26.06 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  25.45 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  26.06 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  31.88 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  24.49 
 
 		 309 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  23.61 
 
 		 306 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  23.61 
 
 		 306 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  23.61 
 
 		 306 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  25.44 
 
 		 182 aa  50.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  29.08 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  22.92 
 
 		 306 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  22.92 
 
 		 306 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  25 
 
 		 312 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  24.5 
 
 		 306 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  32.69 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  22.92 
 
 		 306 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  22.92 
 
 		 306 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  22.92 
 
 		 306 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  24.79 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1838  CheW protein  26.95 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00299326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  22.88 
 
 		 308 aa  48.5  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  24.31 
 
 		 309 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  24.5 
 
 		 306 aa  48.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  24.31 
 
 		 309 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  22.88 
 
 		 308 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  24.31 
 
 		 309 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  24.14 
 
 		 179 aa  47.8  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  24.5 
 
 		 307 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1139  response regulator receiver:CheW-like protein  24.14 
 
 		 298 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  22.92 
 
 		 306 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  29.93 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.67 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  29.2 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  34.29 
 
 		 531 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  21.9 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  23.81 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  19.87 
 
 		 478 aa  46.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.6 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  35.29 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4654  CheW protein  27.35 
 
 		 300 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  25 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  31.33 
 
 		 299 aa  45.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  30.12 
 
 		 317 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  30.43 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  31.91 
 
 		 299 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  30.12 
 
 		 314 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  34.12 
 
 		 297 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  36.36 
 
 		 308 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  31.17 
 
 		 310 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  31.91 
 
 		 299 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  28.57 
 
 		 314 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.5 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  31.33 
 
 		 312 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.5 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  25.49 
 
 		 314 aa  44.7  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  22.37 
 
 		 306 aa  44.7  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  22.22 
 
 		 306 aa  44.7  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  22.3 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  25.69 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>