149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3188 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  100 
 
 		 174 aa  342  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  60.57 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  56 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  54.02 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  54.34 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  55.17 
 
 		 175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  55.17 
 
 		 175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  55.43 
 
 		 176 aa  167  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  52.27 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  53.93 
 
 		 177 aa  157  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  49.72 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  37.57 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  33.33 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  35.03 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  38.32 
 
 		 168 aa  91.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  34.66 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  34.46 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  35.03 
 
 		 182 aa  87.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  33.33 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  34.3 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  41.49 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  31.62 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  34.48 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  31.71 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  29.88 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  31.21 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  27.14 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  33.33 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  27.78 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  32.76 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  37 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  33.33 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  28.7 
 
 		 907 aa  52.4  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  28.7 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  32.2 
 
 		 179 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  28.97 
 
 		 170 aa  51.2  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  27.85 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  27.56 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  26.76 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  32.48 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  45.1 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  26.32 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3334  CheW protein  41.27 
 
 		 136 aa  48.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  27 
 
 		 161 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2182  CheW protein  41.79 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  31.87 
 
 		 149 aa  47.8  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  33.33 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  29.75 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  26.36 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  30.51 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  29.23 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  27.36 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  29.47 
 
 		 324 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  21.95 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  24.82 
 
 		 779 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  26.85 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  25.93 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  30.43 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  28.57 
 
 		 199 aa  45.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  24.79 
 
 		 141 aa  45.1  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  41.18 
 
 		 180 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  32.84 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  28.87 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  41.18 
 
 		 180 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  26.26 
 
 		 169 aa  44.3  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  30.91 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.17 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  21.9 
 
 		 478 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  32.29 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  27.17 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  27.17 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  28.26 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  27.17 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  33.06 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0075  CheW protein  33.63 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  26.6 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  26.26 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  27.17 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  32.26 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  27.17 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  32.84 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  25.96 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  32.97 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  32.97 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.17 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  36.19 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00029  chemotaxis protein  30.43 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.377111  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  26.09 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  27.17 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.17 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  37.93 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  21.9 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  23.31 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  27.17 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  27.17 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  27.17 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  27.17 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  32.26 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  27.97 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  27.17 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>