82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3334 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3334  CheW protein  100 
 
 		 136 aa  262  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0624  CheW protein  32.59 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0075  CheW protein  32.86 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0638  CheW protein  38.46 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07762e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0723  putative CheW protein  31.34 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  31.17 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  27.27 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  28.28 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  39.29 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  31.31 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  31.31 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  38.16 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  26.26 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  25.84 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  36.99 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  34.57 
 
 		 175 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  43.75 
 
 		 178 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  34.38 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  23.76 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  34.72 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  28.72 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  35.53 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  25.25 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  43.75 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3063  CheW protein  34.62 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  29.35 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2955  CheW protein  38.71 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  27.36 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  29.79 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  25 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  28.77 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5451  CheW protein  37.33 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  35.53 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  34.25 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  37.93 
 
 		 176 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  28.7 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  37.93 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  36.25 
 
 		 479 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  34.25 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  36.07 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2837  CheW domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.630975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  25.89 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  26.03 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  28.72 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  33.33 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  31 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  31.75 
 
 		 779 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2826  CheW protein  40.86 
 
 		 302 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0351832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  23.19 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  25.81 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  25.51 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  27.83 
 
 		 179 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  27.17 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  28.46 
 
 		 308 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  32.93 
 
 		 168 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  27.14 
 
 		 170 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2371  putative CheW protein  35.05 
 
 		 153 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  32.93 
 
 		 168 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  38.6 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  26.14 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  38.46 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  31.67 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  31.82 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  23.08 
 
 		 158 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  26.14 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  24.3 
 
 		 478 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2918  CheW protein  40.22 
 
 		 301 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00571645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.99 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  25.96 
 
 		 160 aa  40.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2734  CheW protein  38.71 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0273255  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  26.14 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  27.14 
 
 		 907 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  25 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  24.59 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  35.44 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  24.59 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  29.81 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  27.37 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  37.5 
 
 		 176 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  17.59 
 
 		 365 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  30.77 
 
 		 185 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>