49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1138 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  100 
 
 		 176 aa  356  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  76.7 
 
 		 176 aa  283  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  60.8 
 
 		 176 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  64.04 
 
 		 177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  60.57 
 
 		 175 aa  211  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  61.02 
 
 		 175 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  59.89 
 
 		 175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  59.32 
 
 		 175 aa  197  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  59.55 
 
 		 175 aa  197  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  48.28 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  55.43 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  36.52 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  35.91 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  34.86 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  37.7 
 
 		 180 aa  99  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  32.57 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  33.71 
 
 		 181 aa  97.4  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  32 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  36.78 
 
 		 168 aa  94.7  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  32.95 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  34.21 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  29.94 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  27.33 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  30.43 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  30.43 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  28.32 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  30.25 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  30.25 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  26.4 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  31.18 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  26.28 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  24.14 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  29.1 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  26.73 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  31 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  29.01 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  38.81 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  30.7 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  30 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  30 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  26.89 
 
 		 177 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  23.12 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  31.25 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  33.96 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  24.29 
 
 		 181 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  32.43 
 
 		 176 aa  42  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  29.69 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  28.4 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  33.33 
 
 		 149 aa  41.2  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>