73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2550 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  100 
 
 		 174 aa  358  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  40.49 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  38.69 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  36.05 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  33.53 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  34.09 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  32.94 
 
 		 181 aa  97.4  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  32.54 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  32.95 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  35.47 
 
 		 174 aa  84.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  33.33 
 
 		 177 aa  84.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  31.33 
 
 		 180 aa  84.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  32 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  32 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  33.33 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  27.88 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  30.81 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  31.43 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  31.43 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  29.55 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  33.94 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  28.48 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  32.39 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  32.39 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  31.62 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  31.19 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  30.28 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  33.02 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  30.56 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  30 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  24.65 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  27.78 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  26.19 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  37.62 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  37.62 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  37.62 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  37.62 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  33 
 
 		 171 aa  51.6  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  29 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  29.73 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  25.53 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  32 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  22.22 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  32.56 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  35.63 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  24.69 
 
 		 478 aa  44.7  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  37.84 
 
 		 137 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  37.84 
 
 		 137 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  39.34 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  25.56 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0723  putative CheW protein  36.76 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  33.33 
 
 		 313 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  27 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  25.29 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  22.52 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1838  CheW protein  21.51 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00299326 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0075  CheW protein  33.33 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  31.88 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  36.73 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  40.74 
 
 		 215 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2380  CheW protein  21.51 
 
 		 177 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  40.74 
 
 		 221 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  37.7 
 
 		 137 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  29.17 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0742  CheW protein  29.49 
 
 		 275 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  25.71 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  23.94 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  30.86 
 
 		 299 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  30.86 
 
 		 299 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  34.48 
 
 		 161 aa  41.2  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0521  hypothetical protein  29.41 
 
 		 195 aa  40.8  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  39.51 
 
 		 221 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  32.39 
 
 		 212 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>