48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4624 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  100 
 
 		 177 aa  353  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  64.04 
 
 		 176 aa  215  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  59.89 
 
 		 176 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  62.36 
 
 		 175 aa  205  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  61.24 
 
 		 175 aa  204  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  61.8 
 
 		 175 aa  204  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  57.06 
 
 		 176 aa  202  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  59.09 
 
 		 175 aa  201  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  58.99 
 
 		 175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  53.93 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  46.86 
 
 		 176 aa  138  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  35.23 
 
 		 181 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  34.66 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  40.68 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  36.93 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  35.29 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  39.31 
 
 		 168 aa  101  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  34.66 
 
 		 175 aa  97.8  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  32.57 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  33.33 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  34.92 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  29.73 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  27.92 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  32.76 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  33.07 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  33.07 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  25.18 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  27.17 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  31.01 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  35.4 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  28.68 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  31.88 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  31.65 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  31.21 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  26.79 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  38.46 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  26.79 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  27.27 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  24.73 
 
 		 154 aa  44.3  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  24.73 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  24.76 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  24.73 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  24.73 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  30.94 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  33.33 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  26.83 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  26.09 
 
 		 153 aa  41.2  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  26.61 
 
 		 907 aa  40.8  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>