77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3576 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  100 
 
 		 175 aa  347  7e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  99.43 
 
 		 175 aa  345  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  84.57 
 
 		 175 aa  288  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  79.31 
 
 		 175 aa  278  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  67.43 
 
 		 175 aa  239  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  62.36 
 
 		 177 aa  205  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  58.76 
 
 		 176 aa  201  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  59.89 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  56.5 
 
 		 176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  55.17 
 
 		 174 aa  154  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  49.13 
 
 		 176 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  36.99 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  36.16 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  36.78 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  33.53 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  32.95 
 
 		 181 aa  98.2  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  38.82 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  32.53 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  32.56 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  33.73 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  33.53 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  39.39 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  31.43 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  30.28 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  27.95 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  28.99 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  38.61 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  29.34 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  29.7 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  26.06 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  29.82 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  27.81 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  31.96 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  31.96 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  31.08 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  31.08 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  30.25 
 
 		 184 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  25.14 
 
 		 177 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  34.88 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  26.53 
 
 		 907 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  28.46 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  35.09 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  43.4 
 
 		 779 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  25.9 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  42 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  35.9 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  29 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  37.5 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  28.32 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  33.33 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  31.07 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0521  hypothetical protein  32.93 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  35 
 
 		 141 aa  44.7  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  26.61 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  35.58 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  30.84 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  26.62 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  29.89 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  27.4 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  35.38 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  25.64 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.49 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  31.37 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.49 
 
 		 164 aa  42  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.65 
 
 		 178 aa  42  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  36.51 
 
 		 162 aa  42  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5451  CheW protein  34.94 
 
 		 190 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  24.24 
 
 		 189 aa  41.6  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.49 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  27.27 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  25 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2182  CheW protein  35.42 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  27.63 
 
 		 205 aa  41.2  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  34.04 
 
 		 200 aa  41.2  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  22.83 
 
 		 177 aa  40.8  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  31 
 
 		 155 aa  40.8  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  42.86 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>