204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5451 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5451  CheW protein  100 
 
 		 190 aa  348  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3063  CheW protein  44.06 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2837  CheW domain-containing protein  42.66 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.630975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2955  CheW protein  43.57 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2184  CheW protein  48.39 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  41.24 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  37.84 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  39.18 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  27.1 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  29.82 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  29.55 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  26.52 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  31.65 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  29.55 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  28.03 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.03 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  27.84 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  28.03 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  28.03 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  28.03 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  28.03 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  28.03 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  28.79 
 
 		 161 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  28.03 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  23.53 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  28.03 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  28.03 
 
 		 164 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.79 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  26.13 
 
 		 302 aa  51.6  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  30.3 
 
 		 160 aa  51.6  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  30.46 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  34.09 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  34.09 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  32.54 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  25.17 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  29.77 
 
 		 518 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  30.88 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  28.81 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  30.34 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  27.27 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  28.37 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  30.53 
 
 		 161 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  27.88 
 
 		 162 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  29.09 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  32.58 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  27.27 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  25.17 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  23.77 
 
 		 466 aa  49.3  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  34.04 
 
 		 144 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  27.17 
 
 		 159 aa  48.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  25 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  30.43 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  24.03 
 
 		 168 aa  48.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  28.45 
 
 		 169 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1325  CheW protein  33.67 
 
 		 161 aa  48.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  48.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  25.49 
 
 		 164 aa  47.8  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  27.97 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  26.72 
 
 		 156 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  26.72 
 
 		 156 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  31.82 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  29.19 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  31.51 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  24.22 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  29.01 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  28.09 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  31.82 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.91 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.68 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  25 
 
 		 365 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  31.82 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  24.64 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  30.68 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  26.37 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  21.19 
 
 		 907 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  24.84 
 
 		 253 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  30.68 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  27.39 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  25.19 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  27.69 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0598  CheW protein  30.49 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  31.82 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1730  CheW protein  29.71 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  24.32 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  27.69 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  27.97 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  30.68 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0388  CheW protein  27.54 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  34.29 
 
 		 479 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  28.26 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  25.69 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  32.82 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1154  putative CheW protein  28.7 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.239991  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  25.44 
 
 		 159 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  29.33 
 
 		 165 aa  45.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  24.8 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  28.16 
 
 		 152 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  30.71 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  27.97 
 
 		 154 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>