More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0258 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  100 
 
 		 152 aa  303  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  33.11 
 
 		 163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  35.66 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  33.79 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  33.11 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  34.46 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  34.46 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.78 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  35.66 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  37.67 
 
 		 183 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  40.41 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  31.76 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  31.08 
 
 		 163 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  31.72 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  32.41 
 
 		 164 aa  97.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  32.41 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  32.43 
 
 		 164 aa  97.4  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  31.08 
 
 		 161 aa  97.1  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  32.17 
 
 		 164 aa  97.1  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  34.29 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.72 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.72 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  33.09 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.72 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.72 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  36.23 
 
 		 187 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  31.72 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  31.72 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  31.72 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.72 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  32.39 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.39 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  31.08 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  32.39 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  32.39 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  32.39 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  32.39 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.34 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  33.1 
 
 		 161 aa  93.6  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  32.39 
 
 		 161 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.97 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  34.75 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  33.1 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  32.91 
 
 		 189 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  35.62 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  33.1 
 
 		 163 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  35.82 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  39.71 
 
 		 158 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  39.71 
 
 		 170 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  39.71 
 
 		 170 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  39.71 
 
 		 170 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  39.71 
 
 		 170 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  39.71 
 
 		 170 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  39.71 
 
 		 170 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  35.33 
 
 		 174 aa  90.5  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  34.72 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  34.27 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  34.25 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  38.24 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  31.47 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  33.33 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  35.42 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  36.62 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  29.45 
 
 		 165 aa  88.6  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  33.33 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  32.09 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  37.67 
 
 		 218 aa  88.2  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  34 
 
 		 171 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  36.67 
 
 		 169 aa  87.8  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  33.33 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  33.33 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30.07 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  34.87 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  28.78 
 
 		 155 aa  87  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  35.37 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  37.01 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  34.69 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  33.33 
 
 		 177 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  35.07 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  33.33 
 
 		 177 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  33.79 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  33.33 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  38.03 
 
 		 192 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  33.57 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  33.33 
 
 		 175 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  33.33 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  31.65 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  32.87 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  32.35 
 
 		 175 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  33.1 
 
 		 174 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.08 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  33.8 
 
 		 205 aa  85.1  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>