253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3063 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3063  CheW protein  100 
 
 		 185 aa  352  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2837  CheW domain-containing protein  97.84 
 
 		 185 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.630975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2955  CheW protein  81.62 
 
 		 184 aa  249  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2184  CheW protein  51.03 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5451  CheW protein  43.31 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  26.92 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  29.01 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  35.45 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  28.57 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  31.01 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  29.85 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  25.96 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  25.2 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  25.2 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  31.07 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  28.57 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  28.8 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  28.57 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  28.57 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  24.39 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  30.83 
 
 		 200 aa  52  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  28.67 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  30.69 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  28.85 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  27.84 
 
 		 154 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  28.1 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  27.37 
 
 		 140 aa  52  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  28.1 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  28.1 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  28.1 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  28.1 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  28.93 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  27.83 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  28.1 
 
 		 171 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  28.57 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  28.57 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  27.83 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  27.83 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  26.8 
 
 		 163 aa  51.6  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  27.83 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  27.83 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  27.83 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  27.96 
 
 		 167 aa  51.2  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  28.57 
 
 		 165 aa  51.2  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  28.42 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  32.71 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  32.54 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  28.41 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  27.45 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  27 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  27 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  23.53 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0722  CheW protein  28.57 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  27 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  27 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  25.56 
 
 		 141 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  27 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  27 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  27 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  24.55 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  28.24 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  32.18 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  27.08 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  28.74 
 
 		 175 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  29.87 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.41 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  28.74 
 
 		 174 aa  48.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  28.41 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  28.41 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  25.53 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  28.41 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  25.69 
 
 		 907 aa  48.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  35.88 
 
 		 475 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  28.41 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  26.36 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  28.41 
 
 		 164 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  28.41 
 
 		 164 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  28.7 
 
 		 156 aa  47.8  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  28.41 
 
 		 164 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  28.41 
 
 		 164 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  27.86 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  28.7 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  28.87 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  26 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  24.53 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  27.03 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  25.23 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  28.87 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  28.83 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  27.86 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  27.86 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2706  CheW protein  34.83 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  26.73 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  27.86 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  32.86 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  24.83 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  33.66 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.7 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  26.42 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  27.86 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>