173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2955 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2955  CheW protein  100 
 
 		 184 aa  352  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2837  CheW domain-containing protein  81.08 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.630975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3063  CheW protein  81.62 
 
 		 185 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2184  CheW protein  52.41 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5451  CheW protein  42.86 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  29.6 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  28.12 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  32.74 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  27.61 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  29.27 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  29.36 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  29.82 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2031  CheW protein  33.05 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.505139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  25.21 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  30.25 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  30.22 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  38.04 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  35.38 
 
 		 475 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  27.96 
 
 		 154 aa  48.5  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  27.17 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  26.88 
 
 		 140 aa  48.5  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  30.36 
 
 		 162 aa  48.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  26.76 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  27.08 
 
 		 302 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  23.4 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  28.07 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  26.42 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  27.08 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  34.62 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  27.36 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  26.53 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  44.12 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  27.1 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  44.12 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  44.12 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  25.77 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  26.53 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0722  CheW protein  28.87 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0090  CheW protein  27.78 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  34.07 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  25.66 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  27.36 
 
 		 253 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  24.24 
 
 		 155 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  26.42 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  30.93 
 
 		 139 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2188  CheW protein  33.87 
 
 		 153 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  27.84 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  28.44 
 
 		 167 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  28.7 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  28.44 
 
 		 167 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  28.44 
 
 		 167 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  28.44 
 
 		 167 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  28.44 
 
 		 167 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  26.67 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  23.61 
 
 		 164 aa  45.1  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3334  CheW protein  38.71 
 
 		 136 aa  44.7  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  27.89 
 
 		 160 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  30.77 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  35.56 
 
 		 479 aa  44.7  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  24.07 
 
 		 158 aa  44.3  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  26.67 
 
 		 159 aa  44.3  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  29.55 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  27.06 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  33.33 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  35.63 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  35.63 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2458  CheW protein  30.53 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211003  normal  0.0838028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  32.5 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  25.48 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  35.59 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  28.28 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  28.57 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  27.06 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  28.42 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  28.42 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2293  putative CheW protein  32.76 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  27.1 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  22.86 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  27.78 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  27.78 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  28.28 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  25.47 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  26.24 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.06 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  36.84 
 
 		 306 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  30.65 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  27.78 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  30.59 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  27.78 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  27.78 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  27.78 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  27.78 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  29.63 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  26.85 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  23.91 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0723  putative CheW protein  35.42 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  28.57 
 
 		 568 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  35.29 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  29 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  22.86 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>