131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0614 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  98.34 
 
 		 181 aa  362  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  83.89 
 
 		 181 aa  305  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  57.22 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  58.1 
 
 		 182 aa  197  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  43.2 
 
 		 168 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  34.66 
 
 		 177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  34.71 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  32.95 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  32.95 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  32.95 
 
 		 175 aa  97.8  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  32 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  31.03 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  32.37 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  36.57 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  33.92 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  32.94 
 
 		 174 aa  84.3  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  27.43 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  30.06 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  34.46 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  26.24 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  21.95 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.6 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  30.83 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  31.91 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  32.12 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  32.12 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.39 
 
 		 174 aa  51.2  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  26.95 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  27.69 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  29.93 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  31.91 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  28.97 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  31.91 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  24.31 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  30.6 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  27.21 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  27.54 
 
 		 779 aa  48.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  26.02 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  27.81 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.44 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.95 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.54 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  25.22 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  31.54 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  31.54 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  31.54 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  24.82 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  25.17 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  29.08 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  29.6 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.54 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  29.71 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.54 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.54 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  29.32 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  29.77 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.54 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  29.2 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  27.08 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  29.77 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  23.36 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  29.37 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  34.72 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  27.56 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  27.21 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  35.06 
 
 		 159 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  29.93 
 
 		 164 aa  45.1  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  24.11 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  28.77 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  22.79 
 
 		 154 aa  45.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  22.79 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  22.79 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.29 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  27.78 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  30.56 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  27.78 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  32.29 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  32.29 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  32.29 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  28.99 
 
 		 164 aa  44.7  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  22.06 
 
 		 154 aa  44.7  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  26.45 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  25.83 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  29.36 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  28.28 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  22.88 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  29.36 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  30.85 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  30.85 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  27.21 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  26.4 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  24.53 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  23.13 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  26.95 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3334  CheW protein  34.25 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  27.64 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  29.14 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  37.04 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  28.48 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>