More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1094 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  100 
 
 		 168 aa  338  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  94.05 
 
 		 168 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  93.45 
 
 		 168 aa  316  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  74.07 
 
 		 168 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  60.71 
 
 		 178 aa  200  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  54.39 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1494  CheW domain protein  53.8 
 
 		 178 aa  169  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  55.78 
 
 		 171 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  54.42 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  56.76 
 
 		 162 aa  150  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  52.67 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  43.62 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  41.92 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3978  CheW protein  44 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  38.85 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  38.46 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  39.13 
 
 		 170 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  39.13 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  37.58 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  37.58 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  40.26 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  38.92 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  38.92 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  38.92 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  38.92 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  38.92 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  38.92 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  36.94 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  36.43 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  36.43 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  34.21 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  35.53 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  29.59 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  28.38 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  33.02 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  26.15 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  33.33 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  32.38 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  23.42 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  35.51 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  26.77 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  29.91 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  32.38 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0324  CheW protein  27.5 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0635  CheW protein  30.46 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  32.22 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  30.48 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  30.39 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  32.22 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  29.55 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  25.66 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  26.53 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  29.29 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  27.41 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.36 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  24.78 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  25.77 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0644  CheW protein  29.8 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.35775  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  27.61 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.05 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  29.06 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  29.82 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  31.43 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  24.82 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0610  CheW protein  29.8 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  29.14 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  23.46 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.69 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  27.03 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  24.24 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  26.09 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  26.09 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  24.82 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  24.82 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  24.82 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.85 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  24.82 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  24.82 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  24.82 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  29.57 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  29.57 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.52 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  24.82 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  24.14 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  23.29 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  32.53 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  33.64 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  27.22 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  31 
 
 		 325 aa  54.3  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  33.64 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  27.97 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  24.11 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  23.31 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  22.73 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  24.49 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  35.42 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  22.73 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  26.53 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.13 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  25.71 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>