More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1053 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  100 
 
 		 178 aa  359  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1494  CheW domain protein  64.2 
 
 		 178 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  64.2 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  64.24 
 
 		 168 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  60.71 
 
 		 168 aa  200  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  60.12 
 
 		 168 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  60.12 
 
 		 168 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  66.23 
 
 		 171 aa  197  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  61.35 
 
 		 171 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  60.14 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  57.52 
 
 		 157 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  50 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  46 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3978  CheW protein  47.68 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  48.05 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  48.05 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  48.05 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  48.05 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  48.05 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  48.05 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  48.05 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  41.89 
 
 		 155 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  41.89 
 
 		 155 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  43.23 
 
 		 170 aa  124  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  42.24 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  41.61 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  41.94 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  40.76 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  41.94 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  41.29 
 
 		 170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  41.73 
 
 		 144 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  41.1 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  33.62 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  30.19 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  26.32 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  28.7 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  36.46 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  29.25 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.56 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  28.75 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  27.73 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  31.43 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  29.38 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  35.42 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  27.18 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  35.42 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  26.12 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  22.5 
 
 		 136 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0149  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.02 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  30 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  30.77 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  25.52 
 
 		 169 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  28.32 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  30 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  30 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  30 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  25.2 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  30.72 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  27.33 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  27.1 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  24.48 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  27.08 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  26.56 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  27.33 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  24.76 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  30 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  23.08 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  25 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  25.78 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  26.5 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  36 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  30.97 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  25 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  24.83 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  23.73 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  28.68 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  24.79 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  32.38 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0654  putative CheW protein  38.1 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  29.29 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  27.27 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  25 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  29.7 
 
 		 518 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  26 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  26 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  26.4 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  32.26 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  25.47 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  29.17 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  25.78 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  26 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  27.83 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  26 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  25.64 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.27 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  29.29 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  29.29 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  29.29 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  29 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  30.69 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>