260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3972 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  100 
 
 		 157 aa  315  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  68.39 
 
 		 162 aa  206  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  58.67 
 
 		 171 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  56.95 
 
 		 171 aa  163  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  57.52 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  54 
 
 		 178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1494  CheW domain protein  53.33 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  54.67 
 
 		 168 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  54.67 
 
 		 168 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  49.35 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  52.67 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  51.63 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3978  CheW protein  48.39 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  48 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  46.67 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  47.4 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  46 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  46 
 
 		 170 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  46 
 
 		 170 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  46.75 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  46.75 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  46.75 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  46.75 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  46.75 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  46.75 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  46.15 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  45.33 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  43.51 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  34.21 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  34.21 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  33.99 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0635  CheW protein  39.47 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0610  CheW protein  39.47 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0644  CheW protein  39.47 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.35775  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  32.58 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0654  putative CheW protein  36.84 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  26.35 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.18 
 
 		 178 aa  51.2  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  25.41 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.43 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  27.78 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  32.48 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  30.1 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  28.16 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  38.46 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  23.53 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  31.13 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.19 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.19 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  26.98 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.31 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  44 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  23.58 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  37.18 
 
 		 212 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  37.66 
 
 		 212 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  30.19 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  24.31 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  31.62 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  31.62 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  24.31 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  24.31 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  37.74 
 
 		 158 aa  47.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  24.83 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  34 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  24 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  29.58 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  29.58 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  27.27 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  24.22 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  25.32 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  25.21 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.16 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  35.85 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  28.18 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  32.88 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  24.07 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  28.77 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  29.25 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  37.74 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  35.85 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  23.96 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  39.34 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  29.79 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  35.85 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  29.79 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  22.22 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  37.04 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  25.2 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  25.48 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  27.18 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.74 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  31.43 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  30.26 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  22.92 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  23.61 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  22.92 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  25.49 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  24.83 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  28.3 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>