247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0828 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  100 
 
 		 191 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  40.43 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  40.43 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  38.46 
 
 		 172 aa  94.7  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  37.41 
 
 		 156 aa  94.4  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  37.11 
 
 		 170 aa  91.3  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  41.1 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  37.86 
 
 		 172 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  37.86 
 
 		 172 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  37.86 
 
 		 172 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  37.86 
 
 		 172 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  37.86 
 
 		 180 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  37.86 
 
 		 172 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  37.86 
 
 		 172 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  48.48 
 
 		 144 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  39.31 
 
 		 171 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  35.86 
 
 		 170 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  35.86 
 
 		 170 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3978  CheW protein  38.46 
 
 		 156 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  34.97 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  35.17 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  35.19 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1494  CheW domain protein  36 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  36 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  35.62 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  34.57 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  36.84 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  36.84 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  35.53 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  36.81 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  35.66 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  31.85 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  24.85 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  30.66 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  28.23 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  29.03 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  24.82 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  34.38 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  38.32 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  28.79 
 
 		 518 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  29.55 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0388  CheW protein  25.66 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  36.11 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  23.84 
 
 		 478 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.77 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.77 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  38 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  34.95 
 
 		 568 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.77 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  37.38 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  37.38 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  32.58 
 
 		 169 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  37.89 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  26.95 
 
 		 165 aa  52  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  39.62 
 
 		 168 aa  51.6  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  36.84 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  27.27 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  29.41 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  28.68 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  37.74 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  24.85 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  34.25 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  25.19 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  34.41 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.71 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  30.34 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  34.07 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  22.62 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  27.87 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  22.62 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  29.66 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28.38 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  27.94 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.94 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  32.37 
 
 		 155 aa  48.5  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0995  putative CheW protein  30.65 
 
 		 146 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  35.85 
 
 		 174 aa  48.5  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  32.88 
 
 		 173 aa  48.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  17.43 
 
 		 466 aa  48.1  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  22.48 
 
 		 148 aa  48.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2282  CheW protein  34.72 
 
 		 160 aa  48.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0124299  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  39.62 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  22.14 
 
 		 157 aa  48.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.34 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  26.97 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  27.78 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  29.45 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  23.73 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  26 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  33.96 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  31.5 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  27.55 
 
 		 515 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  31.37 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  26.83 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  32.22 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  27.2 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  23.03 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  32.22 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  31.91 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  26.36 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>