More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4233 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  100 
 
 		 168 aa  336  9e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  98.81 
 
 		 168 aa  332  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  93.45 
 
 		 168 aa  316  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  74.69 
 
 		 168 aa  234  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  60.12 
 
 		 178 aa  198  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  54.39 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1494  CheW domain protein  56.96 
 
 		 178 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  55.78 
 
 		 171 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  55.78 
 
 		 171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  57.43 
 
 		 162 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  54.67 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  43.62 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  41.92 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3978  CheW protein  44.67 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  39.1 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  39.1 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  39.75 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  39.75 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  39.52 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  39.52 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  39.52 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  40.91 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  39.52 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  39.52 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  39.52 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  37.82 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  37.82 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  37.18 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  36.43 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  36.43 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  36.69 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  39.71 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  34.34 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  23.6 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  29.59 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  25.69 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  26.61 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  25.69 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0324  CheW protein  29.17 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  26.12 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  33.33 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  24.32 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  29.91 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  26 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  28.21 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  32.08 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  35.51 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  27.03 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  29.55 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  31.43 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.48 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  30.48 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  31.43 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  27.55 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  29.1 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  32.22 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  25.77 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  31.43 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  32.22 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  28.21 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  26.12 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.27 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  28 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.77 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  30.77 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  25.51 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  23.78 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.71 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  23.08 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.69 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  27.62 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  33.9 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  30.51 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  33.9 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  24.49 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.05 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  24.49 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  28.47 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  17.95 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0635  CheW protein  29.08 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  28.12 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  28.21 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  25.23 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  22.32 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  21.8 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  29.1 
 
 		 306 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0644  CheW protein  30.99 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.35775  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  26.8 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  25.64 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  23.19 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0610  CheW protein  30.99 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  25.64 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  27.85 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  28.05 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  24.3 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  28.05 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  25.44 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  27.85 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  28.05 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  30.6 
 
 		 314 aa  52.4  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>