162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4945 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  100 
 
 
170 aa  332  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  80.59 
 
 
170 aa  269  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  80 
 
 
170 aa  264  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  80 
 
 
170 aa  264  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  80.59 
 
 
170 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  80 
 
 
170 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  79.41 
 
 
170 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  65.16 
 
 
172 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  65.16 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  65.16 
 
 
172 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  65.16 
 
 
172 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  65.16 
 
 
172 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  65.16 
 
 
172 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  65.16 
 
 
172 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  65.16 
 
 
172 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  57.82 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3978  CheW protein  47.33 
 
 
156 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  44.74 
 
 
171 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  44.74 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  43.51 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  40.76 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  41.18 
 
 
168 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  41.33 
 
 
178 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1494  CheW domain protein  41.33 
 
 
178 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  43.33 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  39.1 
 
 
168 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  39.1 
 
 
168 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  38.46 
 
 
168 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  32.14 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  37.11 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  32.14 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  25.69 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2282  CheW protein  27.27 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0124299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0324  CheW protein  29.41 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0090  CheW protein  21.01 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.48 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0329  CheW protein  24.65 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  32.73 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  22.63 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  22.22 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  26.85 
 
 
161 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  24.5 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  25.66 
 
 
167 aa  51.6  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  31.82 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  23.13 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  31.82 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  19.51 
 
 
478 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  23.68 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.32 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  29.46 
 
 
779 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  26.32 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  37.21 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  26.32 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  26.32 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0635  CheW protein  26.62 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  26.25 
 
 
164 aa  48.1  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  28 
 
 
169 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  26.06 
 
 
164 aa  48.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  28 
 
 
169 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  27.73 
 
 
170 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  31.34 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  20.65 
 
 
180 aa  47.4  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  26.32 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  26.32 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  26.32 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  26.32 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  24.36 
 
 
158 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  37.1 
 
 
181 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  18.62 
 
 
146 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  25.66 
 
 
164 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  23.38 
 
 
160 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  24.29 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  41.51 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  28.99 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  20.13 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  32.77 
 
 
475 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  23.15 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0755  CheW protein  24 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0610  CheW protein  25.32 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  23.15 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  24.29 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.06 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  21.77 
 
 
139 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  24.82 
 
 
160 aa  45.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0644  CheW protein  25.32 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.35775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  22.37 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  37.74 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  21.71 
 
 
164 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.18 
 
 
174 aa  45.1  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  21.71 
 
 
164 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  31.03 
 
 
218 aa  45.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  21.71 
 
 
170 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  35.48 
 
 
185 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  35.85 
 
 
163 aa  44.7  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  21.79 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  24.29 
 
 
146 aa  44.7  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  37.74 
 
 
164 aa  44.3  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  38.46 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  33.33 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  20 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>