137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3978 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3978  CheW protein  100 
 
 		 156 aa  308  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  53.16 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  51.63 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  50 
 
 		 180 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  49.69 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  49.69 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  49.69 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  49.69 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  49.69 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  49.69 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  52.63 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  50.98 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  53.25 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  48.39 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  47.33 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  45.33 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  47.68 
 
 		 178 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  45.33 
 
 		 168 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  44 
 
 		 170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  44 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  44 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  44 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1494  CheW domain protein  45.03 
 
 		 178 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  45.03 
 
 		 178 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  43.33 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  44.67 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  44.67 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  44 
 
 		 168 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  40 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  40 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  38.46 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  32.64 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  26.9 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  25.52 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  25.52 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  25 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  23.61 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.83 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  25.52 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  23.61 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  24.14 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  24.83 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  24.83 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  24.83 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  24.83 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  23.61 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  23.76 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  23.61 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  24.83 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  22.92 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  22.92 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  24.83 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  22.92 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  22.92 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  24.11 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  24.83 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  27.45 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  24.83 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  24.83 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  24.83 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  28.97 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  27.46 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  27.89 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  22.22 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  23.13 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  25.35 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  27.1 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  27.7 
 
 		 307 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  25.49 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  23.45 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  33.06 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  24.14 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  23.45 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1325  CheW protein  31.91 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  23.61 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  25.66 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  31.03 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4315  chemotaxis protein  29.89 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0365627  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  25 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  22.92 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  22.07 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  24.16 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0728  CheW protein  25.47 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000233542  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  21.88 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2282  CheW protein  29.87 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0124299  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3562  CheW protein  29.89 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  20.67 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  32.26 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  25.35 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.49 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  30.77 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  30.26 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  27.45 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  26.35 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  25.16 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  25.16 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  26.51 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  34.18 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  25.16 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  25.16 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>