More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4129 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  100 
 
 		 168 aa  339  9e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  74.07 
 
 		 168 aa  241  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  74.69 
 
 		 168 aa  240  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  74.07 
 
 		 168 aa  239  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  64.24 
 
 		 178 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  58.18 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1494  CheW domain protein  61.33 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  55.15 
 
 		 171 aa  177  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  59.74 
 
 		 171 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  51.63 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  53.69 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  46.31 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  46.1 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3978  CheW protein  45.33 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  42.86 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  42.86 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  42.86 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  42.86 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  42.86 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  42.86 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  42.86 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  40.38 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  41.18 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  38.82 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  38.82 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  38.15 
 
 		 170 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  38.15 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  40.14 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  40.14 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  39.46 
 
 		 170 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  40.54 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  32 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  28.57 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  27.73 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  27.73 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  36.81 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  27.73 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  27.73 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  27.73 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  27.73 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  27.73 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  27.73 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.65 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  24.46 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  30.37 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  31.37 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  26.05 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  26.05 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  26.05 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  29.93 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  31.01 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.45 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  26.89 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  41.23 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  31.45 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  31.45 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  31.45 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  32.69 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  27.83 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  39.32 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  35.64 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  35.19 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  31.01 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  24.2 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  25.21 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.01 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.01 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  26.05 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.01 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.01 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  25.21 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  26.89 
 
 		 167 aa  62  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.13 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  26.05 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.61 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  28.42 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  26.05 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  26.05 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  26.05 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  26.05 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  31.53 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  31.15 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  27.19 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  24.36 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  26.28 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  27.21 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  36.19 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  27.15 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  34.44 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  31.85 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  30.19 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  29.7 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  26.55 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  27.03 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  27.27 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  29.57 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  25 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  25 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  28.04 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>