More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1430 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  339  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  90.06 
 
 		 171 aa  306  9e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  66.23 
 
 		 178 aa  197  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  58.6 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1494  CheW domain protein  57.96 
 
 		 178 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  55.15 
 
 		 168 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  61.18 
 
 		 162 aa  167  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  55.78 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  55.78 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  55.78 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  56.95 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  50.63 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3978  CheW protein  50.98 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  48.65 
 
 		 156 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  45.06 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  48.1 
 
 		 180 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  48.1 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  48.1 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  48.1 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  48.1 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  48.1 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  48.1 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  44.81 
 
 		 170 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  43.21 
 
 		 170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  42.6 
 
 		 170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  43.21 
 
 		 170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  44.74 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  42.59 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  40.54 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  40.54 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  40 
 
 		 144 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  39.31 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  28.57 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  30.39 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  27.72 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  29.08 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  32.08 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  32.08 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  25.23 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.43 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  27.43 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  29.52 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2282  CheW protein  27.93 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0124299  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  32.35 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.73 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  32.35 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  27.18 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.77 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.77 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  24.29 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0324  CheW protein  28.57 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  32.35 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  32.8 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  30.56 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  35.62 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  32.65 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  28.12 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0635  CheW protein  40.91 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  25.69 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  26.96 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0654  putative CheW protein  40.54 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  29.63 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  30 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0610  CheW protein  37.93 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.38 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0644  CheW protein  37.93 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.35775  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  24.81 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  27.98 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  26.96 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  32.67 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  29.52 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  32.71 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  25.78 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  32.41 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  25.83 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  29.25 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  26.85 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  28.7 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  31.96 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  24.58 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  27.94 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.44 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  26.96 
 
 		 317 aa  52.4  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  27.94 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.03 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  27.94 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  29.79 
 
 		 310 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  28.28 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  27.94 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  27.94 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3396  putative CheW protein  39.44 
 
 		 295 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  27.94 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  27.94 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  39.53 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  31.37 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  21.14 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0598  CheW protein  44.23 
 
 		 211 aa  52  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  29.29 
 
 		 306 aa  52  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  28.43 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  27.18 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>