195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4576 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  100 
 
 		 170 aa  337  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  100 
 
 		 170 aa  337  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  99.41 
 
 		 170 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  92.94 
 
 		 170 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  86.47 
 
 		 170 aa  290  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  85.88 
 
 		 170 aa  288  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  80 
 
 		 170 aa  264  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  61.59 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  61.59 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  61.59 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  61.59 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  61.59 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  61.59 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  61.59 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  61.59 
 
 		 172 aa  174  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  55.1 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  46 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  43.21 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3978  CheW protein  44 
 
 		 156 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  44.81 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  41.94 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  44.67 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  38.85 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1494  CheW domain protein  39.02 
 
 		 178 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  40.14 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  37.58 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  37.82 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  37.82 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  31.76 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  31.76 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  35.86 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  31.63 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  25.96 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  27.83 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  32.64 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  27 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  23.39 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0090  CheW protein  20.29 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2282  CheW protein  24.81 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0124299  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  39.76 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  27.34 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0635  CheW protein  27.45 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  30.53 
 
 		 779 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  24.82 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  24.83 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  28.16 
 
 		 515 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  27.13 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  26.26 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.82 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  30.91 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  24.82 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  24.82 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  24.82 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  32.23 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0324  CheW protein  27.97 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  30.4 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  25.36 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  24.82 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  30.61 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  30.1 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0610  CheW protein  26.8 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  24.82 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0644  CheW protein  26.8 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.35775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  31.37 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  24.82 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  21.82 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  33.33 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  37.74 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  25.71 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.82 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  28.81 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  24.03 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  24.82 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  24.82 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  25.71 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  24.82 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  22.73 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  24.39 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  29.6 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2182  CheW protein  29.52 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  26.47 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  24.39 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  25 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  30.23 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  27.62 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  29.91 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  19.05 
 
 		 478 aa  46.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  30.43 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.74 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3562  CheW protein  29.91 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  29.13 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  30.23 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  30 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  30 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  21.26 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  27.18 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  26.42 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  25 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  25.71 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  24.78 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>