More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0502 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  100 
 
 
172 aa  332  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  92.44 
 
 
180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  92.44 
 
 
172 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  92.44 
 
 
172 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  92.44 
 
 
172 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  92.44 
 
 
172 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  92.44 
 
 
172 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  92.44 
 
 
172 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  65.81 
 
 
156 aa  194  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  60.48 
 
 
170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  65.16 
 
 
170 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  60 
 
 
170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  60 
 
 
170 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  61.59 
 
 
170 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  61.59 
 
 
170 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  60.98 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3978  CheW protein  53.16 
 
 
156 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  50.63 
 
 
171 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  50.65 
 
 
171 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  50.3 
 
 
162 aa  137  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  50 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1494  CheW domain protein  48.7 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  47.4 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  46.1 
 
 
168 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  47.4 
 
 
178 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  41.92 
 
 
168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  41.92 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  41.92 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  32.26 
 
 
155 aa  90.9  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  32.26 
 
 
155 aa  90.9  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  38.46 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  32.38 
 
 
144 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  40 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  35.62 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  32.73 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  46.67 
 
 
152 aa  54.3  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  34.62 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  36 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  31.82 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2282  CheW protein  33.78 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0124299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  31.82 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.36 
 
 
164 aa  52.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  36 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0654  putative CheW protein  43.24 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119082  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.67 
 
 
164 aa  52  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.67 
 
 
159 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  35.71 
 
 
185 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  25.56 
 
 
183 aa  52  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  34.67 
 
 
159 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  34.67 
 
 
159 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  34.67 
 
 
159 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  41.82 
 
 
180 aa  51.6  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0324  CheW protein  31.94 
 
 
161 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  26.73 
 
 
218 aa  51.6  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  35.71 
 
 
185 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  28.68 
 
 
170 aa  51.6  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  36.11 
 
 
159 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  34.67 
 
 
159 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  33.56 
 
 
154 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  24.07 
 
 
141 aa  51.2  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.15 
 
 
164 aa  51.2  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  34.44 
 
 
175 aa  51.2  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  34.52 
 
 
181 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  30.14 
 
 
167 aa  50.8  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  37.5 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  34.67 
 
 
162 aa  50.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  23.08 
 
 
165 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  36 
 
 
164 aa  50.8  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  36 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  25 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  35.14 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  23.89 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  22.44 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  22.44 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  25.89 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4315  chemotaxis protein  31.17 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  37.33 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  28.18 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  36 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  36 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  23.72 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  22.44 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  36 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  35.14 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.93 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.93 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  34.67 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  27.43 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  36 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0644  CheW protein  40.54 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.35775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  36 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  32.88 
 
 
189 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0610  CheW protein  40.54 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  31.71 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  36 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  36 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  23.72 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  36 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  37.1 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  23.72 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>