More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2069 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  100 
 
 		 144 aa  289  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  52.05 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  52.05 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  41.73 
 
 		 178 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  41.13 
 
 		 171 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1494  CheW domain protein  38.85 
 
 		 178 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  38.13 
 
 		 178 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  40.54 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  37.67 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  48.48 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  34.21 
 
 		 168 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  36.69 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  36.69 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  33.99 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  34.86 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3978  CheW protein  32.64 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  36.36 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  36.7 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  33.03 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  29.45 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.86 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  35.78 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  32.38 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  31.97 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  31.63 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  31.63 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.21 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.21 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  29.71 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  28.28 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.21 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  33 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  32.38 
 
 		 180 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  32.38 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  32.38 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  32.38 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  32.38 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  32.38 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  32.38 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  30 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.24 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  26 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.29 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  30.61 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  29.58 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.81 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  30.61 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  30.56 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  33.33 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  26.67 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  27.15 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  27.15 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  27.15 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  27.15 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  27.15 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  27.15 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  27.15 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  27.15 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  26.17 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  26.17 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  26 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  26 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  25.69 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  27.78 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  27.78 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  28.47 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  32.65 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  32.45 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  25.33 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  28.28 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  26.17 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  28.44 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  32.14 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  24.31 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  32.65 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  30.43 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  32 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  26.03 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  25.68 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  29.05 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  28.47 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  31.88 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  27.14 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  27.14 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  31.13 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  32.5 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  25 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  27.03 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  25.83 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  25.83 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  25.83 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  25.83 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  25.83 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  30.91 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  26.17 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  26.49 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  30.83 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  28.86 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  30.82 
 
 		 163 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>