More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1438 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  100 
 
 		 155 aa  322  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  100 
 
 		 155 aa  322  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  52.05 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  41.89 
 
 		 178 aa  124  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  40.54 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  41.22 
 
 		 171 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  38.82 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1494  CheW domain protein  39.86 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  39.86 
 
 		 178 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3978  CheW protein  40 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  36.43 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  36.43 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  36.43 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  32.69 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  32.26 
 
 		 172 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  34.21 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  35.53 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  30.32 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  30.32 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  30.32 
 
 		 180 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  30.32 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  30.32 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  30.32 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  30.32 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  31.29 
 
 		 170 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  31.76 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  31.54 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  31.76 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  40.14 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  30.87 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  31.08 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  32.14 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  31.65 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  34.21 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  25.55 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  25.55 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  26.28 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  24.82 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  33.65 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  35.78 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  31.25 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7838  CheW protein  36.45 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  30.56 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  33.6 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  32.99 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.71 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  32.97 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  32.08 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.81 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  29.05 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  30.08 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  29.73 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  29.52 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  30.77 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  30 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  25.34 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  32.35 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  25.34 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  32.08 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  30.48 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  34.86 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  32.23 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  34.86 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  29.17 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.18 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  33.94 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  33.33 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  28.08 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  28.08 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  28.08 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  29.33 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  28.3 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  30.48 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  33.03 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  49.06 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  24.46 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  32.38 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  25.17 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  31.4 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  27.27 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  25.18 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  31.78 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  31.78 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.28 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  26.71 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  43.4 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  30.25 
 
 		 313 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  28.3 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  29.5 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4315  chemotaxis protein  32.61 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0365627  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  24.46 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  28.85 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  24.82 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  31.43 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  26.71 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  29.86 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  41.56 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  30.56 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.29 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  30.48 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>