More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3652 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  100 
 
 		 162 aa  327  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  68.39 
 
 		 157 aa  206  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  63.76 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  61.18 
 
 		 171 aa  167  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  60.14 
 
 		 178 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1494  CheW domain protein  56.38 
 
 		 178 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  55.7 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  56.76 
 
 		 168 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  57.43 
 
 		 168 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  57.43 
 
 		 168 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  54.05 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3978  CheW protein  53.25 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  53.69 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  50.3 
 
 		 172 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  47.34 
 
 		 180 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  47.9 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  47.9 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  47.9 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  47.9 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  47.9 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  47.9 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  46 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  46 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  45.33 
 
 		 170 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  44.67 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  44.67 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  44 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  43.33 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  35.53 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  35.53 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  37.67 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  35.66 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  29.17 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  28.28 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  27.59 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  31.37 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  26.9 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  27.45 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  26.9 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  32.35 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  27.59 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.52 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  27.88 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.97 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  28.79 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  27.59 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  27.59 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  27.08 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  27.03 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  26.85 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  26.85 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  26.85 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  27.78 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  26.85 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  26.4 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  26.4 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  26.17 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  26.49 
 
 		 164 aa  57  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  34.62 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  32.35 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  27.4 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  26.39 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  27.59 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  26.39 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  26.39 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  27.33 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  26.17 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  26.39 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  28.33 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.17 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  26.17 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  26.17 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  30.77 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  28.24 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  26.17 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  25.83 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  36.71 
 
 		 313 aa  55.1  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  45.45 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  25.83 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  28.24 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  32.43 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.43 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  26.02 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  35.62 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  31.25 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  44.64 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  32.43 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  32.43 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  29.69 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00413  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.86 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497597  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  27.52 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  25.83 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  46.3 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  27.2 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  25.69 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  26.17 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  42.59 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  24.31 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  33.67 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  23.49 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>