More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0635 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0635  CheW protein  100 
 
 
162 aa  312  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0610  CheW protein  98.15 
 
 
162 aa  306  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0644  CheW protein  97.53 
 
 
162 aa  305  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.35775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0654  putative CheW protein  83.22 
 
 
169 aa  249  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119082  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  36.69 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  29.25 
 
 
162 aa  79  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  26.11 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  30.08 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  24.49 
 
 
183 aa  70.9  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  29.66 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  29.86 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  27.07 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  26.42 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  27.33 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  27.74 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  25.95 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  29.92 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  29.01 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  26.24 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  30.77 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  26.14 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  28.47 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  30.77 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  28.57 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  27.39 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  32.67 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  31.36 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  30.7 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  31.58 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  29.45 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  30.56 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  34.35 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  29.41 
 
 
253 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  28.37 
 
 
182 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  24.11 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  28.47 
 
 
200 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  25.33 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  26.02 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  29.46 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  32.86 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  24.82 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1838  CheW protein  29.6 
 
 
177 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00299326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  28.47 
 
 
199 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  30.67 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  30.57 
 
 
194 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  24.84 
 
 
174 aa  60.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  27.03 
 
 
163 aa  60.8  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  24.48 
 
 
174 aa  60.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2380  CheW protein  28.8 
 
 
177 aa  60.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  30.72 
 
 
192 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  24.63 
 
 
161 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  26.47 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  27.66 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  30.72 
 
 
194 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  26.47 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  27.97 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  25 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  25.68 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  31.03 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  24.26 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  24.24 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  21.8 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  31.54 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  23.53 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  26.32 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  25.19 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  24.65 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  25.68 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  30.46 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  26.83 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  21.39 
 
 
180 aa  58.9  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  25.68 
 
 
171 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  31.17 
 
 
212 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  23.81 
 
 
165 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  26.57 
 
 
163 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  25.68 
 
 
174 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  23.78 
 
 
165 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  22.97 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  23.78 
 
 
165 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  23.13 
 
 
262 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  25.68 
 
 
171 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  25.17 
 
 
167 aa  57.4  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  26.76 
 
 
185 aa  57.4  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  23.58 
 
 
159 aa  57.4  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  25.68 
 
 
177 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  25.68 
 
 
171 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  25.68 
 
 
177 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  26.32 
 
 
185 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  23.66 
 
 
168 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  25 
 
 
164 aa  57.4  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  30.25 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  25.17 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  27.1 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  26.97 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  26.92 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  27.1 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  26.32 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  25.55 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  39.02 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  29.93 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>