75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2182 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2182  CheW protein  100 
 
 		 164 aa  310  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2835  CheW domain-containing protein  56.58 
 
 		 195 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3061  CheW protein  55.92 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2953  CheW protein  54.09 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5449  CheW protein  51.92 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.470199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0240  CheW protein  50.32 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00382894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3074  CheW protein  36.81 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.442292  hitchhiker  0.00529437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  31.36 
 
 		 533 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  37.37 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.6 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  38.61 
 
 		 175 aa  47.4  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  35.16 
 
 		 177 aa  47.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  33.33 
 
 		 308 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  33.33 
 
 		 308 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  23.97 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  29.52 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  29.52 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  24 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  29.41 
 
 		 515 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  24.82 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  33.04 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  33.33 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  33.8 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  20.34 
 
 		 478 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  30 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  37.7 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  24.32 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  28.57 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  33.85 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  35.04 
 
 		 479 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  25.62 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  32.05 
 
 		 311 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  33.59 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  32.89 
 
 		 314 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  33.33 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  39.34 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  29.03 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  37.5 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  34.21 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  42.31 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  30.77 
 
 		 311 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  30.77 
 
 		 311 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  32.86 
 
 		 155 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  33.59 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  30.77 
 
 		 311 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  37.7 
 
 		 170 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  31.17 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  30.77 
 
 		 311 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  31.17 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  30.91 
 
 		 171 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  31.17 
 
 		 158 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  29.91 
 
 		 568 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  26.36 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  26.26 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  42.22 
 
 		 317 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  27.42 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  31.25 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  23.2 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  35.42 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  42.86 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  38.3 
 
 		 310 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  42.22 
 
 		 312 aa  41.2  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  30.65 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  21.14 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3197  CheW protein  35.8 
 
 		 158 aa  41.2  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.37318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  31.25 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  24.65 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  22.05 
 
 		 168 aa  40.8  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  40 
 
 		 175 aa  40.8  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  33.87 
 
 		 314 aa  40.8  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  28.68 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  33.06 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  40.32 
 
 		 172 aa  40.8  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  26.19 
 
 		 146 aa  40.4  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  31.25 
 
 		 169 aa  40.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>