More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1646 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 
311 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  97.11 
 
 
311 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  97.43 
 
 
311 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  97.11 
 
 
311 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  90.2 
 
 
308 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  89.87 
 
 
308 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  88.42 
 
 
311 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  83.71 
 
 
310 aa  535  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  64.8 
 
 
311 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  60.06 
 
 
338 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  58.12 
 
 
314 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  58.44 
 
 
314 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  58.44 
 
 
314 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  58.44 
 
 
314 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  58.12 
 
 
314 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  57.79 
 
 
314 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  57.47 
 
 
317 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  57.79 
 
 
314 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  57.79 
 
 
314 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  57.79 
 
 
314 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  58.12 
 
 
313 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  56.96 
 
 
313 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  57.47 
 
 
313 aa  371  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  56.49 
 
 
312 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  59.22 
 
 
317 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  59.68 
 
 
313 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  57.61 
 
 
314 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  54.55 
 
 
314 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  53.8 
 
 
319 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  57.79 
 
 
314 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  56.58 
 
 
310 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  56.58 
 
 
310 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  54.61 
 
 
310 aa  339  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  54.58 
 
 
309 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  53.04 
 
 
309 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  55.88 
 
 
309 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  55.56 
 
 
309 aa  331  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  55.56 
 
 
309 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  55.92 
 
 
310 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  51.31 
 
 
306 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  52.96 
 
 
308 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  52.96 
 
 
308 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  51.31 
 
 
306 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  51.31 
 
 
306 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  51.31 
 
 
306 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  51.31 
 
 
306 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  51.31 
 
 
306 aa  328  9e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  51.31 
 
 
306 aa  328  9e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  51.31 
 
 
306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  50.98 
 
 
306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  51.31 
 
 
306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  51.46 
 
 
306 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  50.65 
 
 
306 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  51.64 
 
 
316 aa  324  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  50.65 
 
 
306 aa  324  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  50.33 
 
 
306 aa  319  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  50.81 
 
 
308 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  50.16 
 
 
308 aa  317  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 
306 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  51.32 
 
 
306 aa  316  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  49.68 
 
 
309 aa  315  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  48.86 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  50 
 
 
308 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  51.64 
 
 
306 aa  310  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  50.16 
 
 
312 aa  305  6e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  52.12 
 
 
309 aa  302  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  48.24 
 
 
311 aa  298  7e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  48.85 
 
 
310 aa  295  7e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  47.02 
 
 
313 aa  290  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  47.6 
 
 
324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  48.18 
 
 
309 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  48.53 
 
 
314 aa  275  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  49.2 
 
 
314 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  49.2 
 
 
314 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  46.74 
 
 
307 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  48.16 
 
 
248 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  37.94 
 
 
319 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  38.99 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  37.37 
 
 
298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  37.37 
 
 
298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  37.37 
 
 
298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  36.65 
 
 
314 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  37.01 
 
 
298 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  40.5 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  37.34 
 
 
313 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  38.36 
 
 
311 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  38.01 
 
 
299 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  35.23 
 
 
308 aa  195  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0364  response regulator receiver modulated CheW protein  36.54 
 
 
317 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  39.06 
 
 
322 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  36.05 
 
 
320 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  35.59 
 
 
299 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  38.13 
 
 
299 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  36.31 
 
 
316 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  36.31 
 
 
316 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  38.01 
 
 
299 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  38.01 
 
 
299 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  35.94 
 
 
298 aa  192  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  35.97 
 
 
295 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  36.39 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.375026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>