164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0995 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0995  putative CheW protein  100 
 
 		 146 aa  297  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3197  CheW protein  67.83 
 
 		 158 aa  197  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.37318 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2129  CheW protein  37.12 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  35.58 
 
 		 184 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  28.91 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  26.12 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  27.86 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  33.33 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  27.52 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  36.84 
 
 		 520 aa  53.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  31.16 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  33.33 
 
 		 515 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  24.49 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  29.52 
 
 		 478 aa  52  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  30.77 
 
 		 176 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  30.97 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2458  CheW protein  34.65 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211003  normal  0.0838028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  34.62 
 
 		 184 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1768  CheW protein  30.15 
 
 		 514 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110635 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  27.07 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  25.17 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  31.73 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  28.36 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  28.36 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.08 
 
 		 163 aa  50.4  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  30.3 
 
 		 179 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  39.13 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  28.24 
 
 		 907 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  39.13 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  27.21 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.23 
 
 		 164 aa  48.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  25.36 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  26.27 
 
 		 141 aa  48.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  26.95 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  25.71 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  28.16 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  27.62 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  29.52 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  28.7 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  30.61 
 
 		 568 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  30.63 
 
 		 310 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1830  CheW protein  34 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  27.46 
 
 		 533 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  36.63 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  27.27 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  37.33 
 
 		 312 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  28.85 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  26.9 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  36.76 
 
 		 311 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  26.56 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  31.43 
 
 		 531 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  34.26 
 
 		 475 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  35.79 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  31.25 
 
 		 309 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  31.25 
 
 		 309 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  31.25 
 
 		 309 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  27.05 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  30.84 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  31.67 
 
 		 314 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  32.58 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  24.8 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  30.93 
 
 		 310 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  28.07 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  24.17 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  30.93 
 
 		 310 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  27.27 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  27.88 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  30.61 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  24.6 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  27.88 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  35.11 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  26.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  26.92 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  30.61 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  28.28 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  21.97 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  27.43 
 
 		 149 aa  43.9  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  27.93 
 
 		 314 aa  43.9  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2054  CheW protein  36.05 
 
 		 429 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.665842  hitchhiker  0.000288851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  29.79 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  20.83 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  25.24 
 
 		 518 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  29.52 
 
 		 317 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  28.87 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  31.25 
 
 		 309 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  23.02 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  40 
 
 		 311 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  25.19 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  40 
 
 		 308 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  40 
 
 		 308 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  28.95 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  27.91 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  30.37 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  23.02 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  26.72 
 
 		 310 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  40 
 
 		 311 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  25.17 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  33 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30.1 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>