66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1830 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1830  CheW protein  100 
 
 		 173 aa  350  5.9999999999999994e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  30.53 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0767  CheW protein  24.77 
 
 		 365 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  27.66 
 
 		 365 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  23.85 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1325  CheW protein  28.3 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  24.09 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  24.66 
 
 		 478 aa  48.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  41.51 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  32.08 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  23.71 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0995  putative CheW protein  34 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  41.51 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  20.74 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  30.95 
 
 		 346 aa  46.6  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  34.57 
 
 		 306 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  18.66 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  23.23 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  25 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  24.56 
 
 		 136 aa  44.7  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3343  CheW protein  27.91 
 
 		 168 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2774  CheW protein  27.91 
 
 		 168 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.342659  normal  0.192178 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  33.33 
 
 		 183 aa  44.3  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  32.22 
 
 		 311 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  32.22 
 
 		 311 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  26.76 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  26.57 
 
 		 306 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  26.57 
 
 		 306 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0498  putative chemotaxis protein, CheW-like  25.71 
 
 		 302 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.857231  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  32.22 
 
 		 311 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  32.22 
 
 		 311 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  23.93 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  32.22 
 
 		 311 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  26.57 
 
 		 306 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  26.57 
 
 		 306 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  26.57 
 
 		 306 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  26.57 
 
 		 306 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  26.57 
 
 		 306 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  24.73 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  25 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  26.57 
 
 		 306 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3197  CheW protein  27.05 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.37318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  31.11 
 
 		 311 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  21.01 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  29.01 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  39.34 
 
 		 308 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  22.38 
 
 		 342 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  23.17 
 
 		 301 aa  42  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  33.75 
 
 		 308 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  22.67 
 
 		 518 aa  42  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  26.57 
 
 		 306 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  27.78 
 
 		 159 aa  42  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  31.71 
 
 		 316 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  22.56 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  21.68 
 
 		 326 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  25.95 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  23.66 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2779  CheW protein  29.67 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  24.65 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  23.19 
 
 		 160 aa  41.2  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  24.22 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  25 
 
 		 317 aa  40.8  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  23.66 
 
 		 158 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  23.65 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  25.87 
 
 		 306 aa  40.8  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  21.28 
 
 		 328 aa  40.8  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>