21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2779 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2779  CheW protein  100 
 
 		 163 aa  332  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2774  CheW protein  57.97 
 
 		 168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.342659  normal  0.192178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3343  CheW protein  57.97 
 
 		 168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1428  CheW domain protein  37.66 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.201445 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0860  CheW protein  33.33 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.288047  normal  0.124717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  29.17 
 
 		 314 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  29.17 
 
 		 314 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  29.17 
 
 		 314 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  29.17 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2791  hypothetical protein  28.29 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  27.08 
 
 		 317 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  28.47 
 
 		 314 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  27.08 
 
 		 314 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  25.87 
 
 		 478 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  27.78 
 
 		 314 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  27.78 
 
 		 314 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  26.39 
 
 		 313 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  27.78 
 
 		 314 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1830  CheW protein  29.67 
 
 		 173 aa  41.2  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  27.78 
 
 		 314 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1066  CheW domain protein  27.16 
 
 		 200 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00813018  hitchhiker  0.000000321365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>