More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003013 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  100 
 
 		 317 aa  649    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  93.29 
 
 		 313 aa  608  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  78.98 
 
 		 314 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  72.29 
 
 		 313 aa  471  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  70.06 
 
 		 314 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  70.79 
 
 		 314 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  69.21 
 
 		 314 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  69.75 
 
 		 314 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  69.75 
 
 		 314 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  69.75 
 
 		 314 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  70.16 
 
 		 314 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  70.16 
 
 		 314 aa  454  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  69.84 
 
 		 314 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  67.09 
 
 		 317 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  69.33 
 
 		 313 aa  448  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  66.13 
 
 		 312 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  65.4 
 
 		 314 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  68.05 
 
 		 313 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  67.73 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  63.01 
 
 		 319 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  67.62 
 
 		 314 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  60.32 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  59.22 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  60 
 
 		 311 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  58.71 
 
 		 308 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  60.32 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  58.25 
 
 		 310 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  58.39 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  57.74 
 
 		 311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  56.51 
 
 		 311 aa  351  8.999999999999999e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  52.9 
 
 		 309 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  52.58 
 
 		 309 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  52.26 
 
 		 309 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  51.94 
 
 		 309 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  51.61 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  52.17 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  50.97 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  49.68 
 
 		 316 aa  308  6.999999999999999e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  51.61 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  51.29 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  53.23 
 
 		 310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  50.82 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  49.84 
 
 		 306 aa  298  7e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  47.23 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  49.19 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  48.88 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  49.2 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  49.2 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  49.2 
 
 		 306 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  49.2 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  49.04 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  48.87 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  48.87 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  48.87 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  48.87 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  48.22 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  47.9 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  46.93 
 
 		 306 aa  279  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  47.25 
 
 		 306 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  48.41 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  45.48 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  47.71 
 
 		 306 aa  275  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  47.85 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  46.06 
 
 		 324 aa  271  9e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  46.23 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  45.08 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  47.32 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  45.4 
 
 		 308 aa  269  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  45.82 
 
 		 307 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  46.71 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  44.73 
 
 		 314 aa  262  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  43.63 
 
 		 311 aa  260  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  43.77 
 
 		 309 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  44.87 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  44.87 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  44.84 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  38.17 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  35.6 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  35.6 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  38.03 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  35.39 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  34.07 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  34.88 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3396  putative CheW protein  36.62 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  34.38 
 
 		 311 aa  188  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  36.34 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  36.07 
 
 		 316 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1323  chemotaxis protein CheV, putative  36.83 
 
 		 314 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  37.68 
 
 		 299 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  34.78 
 
 		 295 aa  185  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  37.8 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1139  response regulator receiver:CheW-like protein  37.29 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  37.32 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  33.43 
 
 		 320 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  34.04 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  33.92 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4384  response regulator receiver modulated CheW protein  37.59 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.234409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  32.86 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  33.92 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  35.44 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>