More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4573 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 		 316 aa  641    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 		 316 aa  641    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  94.59 
 
 		 313 aa  600  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  61.39 
 
 		 318 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  62.03 
 
 		 320 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  60.26 
 
 		 321 aa  381  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3759  response regulator receiver modulated CheW protein  61.61 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00050568  normal  0.01011 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0364  response regulator receiver modulated CheW protein  60.44 
 
 		 317 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  60.58 
 
 		 321 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  58.68 
 
 		 326 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  58.68 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  57.59 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  56.21 
 
 		 316 aa  362  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  57.37 
 
 		 325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1763  putative CheW protein  57.51 
 
 		 320 aa  356  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  58.68 
 
 		 317 aa  352  5e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2450  CheW protein  55.77 
 
 		 333 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.979041  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2658  CheW protein  55.77 
 
 		 333 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2543  CheW protein  55.77 
 
 		 334 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2554  CheW protein  55.77 
 
 		 334 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2499  CheW protein  55.45 
 
 		 334 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2819  putative CheW protein  55.77 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  43.69 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  40.57 
 
 		 322 aa  232  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  40.95 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  37.7 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  37.7 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  37.7 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  37.7 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  38.66 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  37.7 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  38.54 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  37.38 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  37.38 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  37.5 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  38.29 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  38.71 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  39.31 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  38.32 
 
 		 314 aa  209  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  37.7 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  37.96 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  39.02 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  38.1 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  37.66 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  36.36 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  37.66 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  37.66 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  38.26 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  37.78 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  37.66 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  37.78 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  37.78 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  38.54 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  36.74 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  37.38 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  36.42 
 
 		 313 aa  205  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  36.39 
 
 		 309 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  37.7 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  35.29 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  36.56 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  35.87 
 
 		 313 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  35.58 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  36.36 
 
 		 314 aa  202  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  36.91 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  36.74 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  35.26 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  36.66 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  36.45 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  37.26 
 
 		 338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  37.96 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  35.92 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  35.6 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  35.92 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  35.48 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  35.6 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  35.4 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  35.14 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  36.39 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  35.74 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  34.84 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  34.97 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  36.62 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  36.62 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  36.36 
 
 		 309 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  34.84 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  35.65 
 
 		 313 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  35.6 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  34.29 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  37.66 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  35.87 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  36.62 
 
 		 311 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  36.31 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  36.91 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  36.91 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  35.4 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  36.39 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  36.94 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  35.5 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  36.51 
 
 		 314 aa  185  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  36.75 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>