More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02930 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  100 
 
 		 248 aa  505  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  80.25 
 
 		 306 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  67.49 
 
 		 306 aa  339  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  65.84 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  64.63 
 
 		 307 aa  331  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  65.43 
 
 		 306 aa  331  8e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  66.26 
 
 		 306 aa  329  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  65.84 
 
 		 306 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  65.84 
 
 		 306 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  65.84 
 
 		 306 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  65.84 
 
 		 306 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  66.26 
 
 		 306 aa  328  7e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  66.26 
 
 		 306 aa  327  8e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  65.43 
 
 		 306 aa  327  9e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  66.26 
 
 		 306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  65.43 
 
 		 306 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  65.43 
 
 		 306 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  64.61 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  60.73 
 
 		 309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  59.5 
 
 		 306 aa  302  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  57.32 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  56.28 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  56.5 
 
 		 308 aa  292  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  54.81 
 
 		 316 aa  278  8e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  55.23 
 
 		 310 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  55.65 
 
 		 310 aa  274  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  55.23 
 
 		 310 aa  272  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  52.72 
 
 		 310 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  51.87 
 
 		 309 aa  265  7e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  53.56 
 
 		 308 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  53.56 
 
 		 308 aa  264  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  53.53 
 
 		 309 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  51.46 
 
 		 310 aa  261  8.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  51.69 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  50.2 
 
 		 313 aa  254  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  54.58 
 
 		 309 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  54.17 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  54.17 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  49.59 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  48.56 
 
 		 310 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  48.37 
 
 		 311 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  48.16 
 
 		 311 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  49.18 
 
 		 308 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  47.54 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  47.54 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  47.54 
 
 		 311 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  46.06 
 
 		 311 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  47.15 
 
 		 312 aa  230  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  44.81 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  48.19 
 
 		 314 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  46.69 
 
 		 311 aa  223  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  47.2 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  46.56 
 
 		 314 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  46.56 
 
 		 314 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  46.56 
 
 		 314 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  46.56 
 
 		 314 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  46.56 
 
 		 319 aa  218  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  46.15 
 
 		 313 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  46.96 
 
 		 314 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  46.96 
 
 		 314 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  46.96 
 
 		 314 aa  217  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  44.84 
 
 		 317 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  46.37 
 
 		 313 aa  217  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  48.76 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  45.24 
 
 		 313 aa  217  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  46.96 
 
 		 314 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  46.56 
 
 		 312 aa  214  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  45.75 
 
 		 313 aa  214  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  46.15 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  46.15 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  44.05 
 
 		 314 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  44.05 
 
 		 314 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  46.59 
 
 		 314 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  43.5 
 
 		 314 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  43.25 
 
 		 314 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  43.15 
 
 		 324 aa  198  7.999999999999999e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  38.02 
 
 		 295 aa  168  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  37.92 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  38.02 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  37.04 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  38.33 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  36.78 
 
 		 299 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  35.95 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  35.54 
 
 		 299 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0498  putative chemotaxis protein, CheW-like  36.67 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.857231  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  35.54 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  35.54 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  35.83 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  35.83 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  35.83 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  35.83 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  35.42 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  36.4 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  35.69 
 
 		 325 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1139  response regulator receiver:CheW-like protein  37.71 
 
 		 298 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  36.9 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  36.4 
 
 		 299 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  36.55 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4654  CheW protein  36.93 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3396  putative CheW protein  35.27 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>