More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1176 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  100 
 
 
309 aa  630  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  63.4 
 
 
309 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  63.73 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  63.49 
 
 
310 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  63.04 
 
 
308 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  63.04 
 
 
308 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  61.44 
 
 
310 aa  394  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  60.59 
 
 
309 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  62.42 
 
 
309 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  62.42 
 
 
309 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  62.09 
 
 
309 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  61.84 
 
 
316 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  59.16 
 
 
308 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  62.42 
 
 
310 aa  374  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  59.62 
 
 
308 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  59.34 
 
 
308 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  59.22 
 
 
306 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  59.27 
 
 
306 aa  371  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  59.27 
 
 
306 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  57.95 
 
 
306 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  58.28 
 
 
306 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  58.28 
 
 
306 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  58.28 
 
 
306 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  58.28 
 
 
306 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  58.28 
 
 
306 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  57.95 
 
 
306 aa  364  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  57.62 
 
 
306 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  57.62 
 
 
306 aa  362  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  57.62 
 
 
306 aa  362  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  56.95 
 
 
307 aa  362  6e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  57.28 
 
 
306 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  55.84 
 
 
306 aa  358  5e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  56.95 
 
 
306 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  56.62 
 
 
306 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  54.07 
 
 
310 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  53.8 
 
 
309 aa  339  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  54.64 
 
 
310 aa  330  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  50.96 
 
 
311 aa  324  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  51.64 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  52.12 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  52.46 
 
 
311 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  53.11 
 
 
311 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  52.46 
 
 
311 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  51.78 
 
 
311 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  51.32 
 
 
308 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  50.99 
 
 
312 aa  316  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  50.82 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  49.67 
 
 
313 aa  311  6.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  50.16 
 
 
309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  50.49 
 
 
338 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  49.52 
 
 
314 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  49.84 
 
 
314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  49.84 
 
 
314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  49.84 
 
 
314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  49.37 
 
 
314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  49.37 
 
 
314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  49.37 
 
 
314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  49.37 
 
 
314 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  50.16 
 
 
314 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  49.35 
 
 
312 aa  299  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  50.33 
 
 
313 aa  298  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  45.05 
 
 
324 aa  298  6e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  48.22 
 
 
317 aa  296  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  49.83 
 
 
313 aa  295  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  49.05 
 
 
314 aa  295  8e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  48.2 
 
 
314 aa  289  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  48.4 
 
 
313 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  46.75 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  46.75 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  46.71 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  46.67 
 
 
314 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  46.41 
 
 
319 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  45.51 
 
 
313 aa  279  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  47.92 
 
 
307 aa  278  8e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  49.35 
 
 
314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  51.87 
 
 
248 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  39.58 
 
 
314 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  39.36 
 
 
308 aa  216  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  37.55 
 
 
295 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  37.85 
 
 
322 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  37.58 
 
 
313 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  37.18 
 
 
298 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  37.27 
 
 
316 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  37.27 
 
 
316 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  38.27 
 
 
299 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  37.54 
 
 
320 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2225  response regulator receiver modulated CheW protein  37.46 
 
 
318 aa  205  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  37.66 
 
 
322 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  38.05 
 
 
297 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  37.27 
 
 
318 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  38.71 
 
 
319 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  37.17 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  34.75 
 
 
299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  34.95 
 
 
326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  34.85 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  34.5 
 
 
325 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  34.62 
 
 
299 aa  195  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  34.62 
 
 
299 aa  195  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  34.62 
 
 
299 aa  195  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  35.11 
 
 
298 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>