More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2225 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2225  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 
318 aa  653    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2364  response regulator receiver modulated CheW protein  58.53 
 
 
297 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  45.97 
 
 
312 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0629  response regulator receiver modulated CheW protein  42.86 
 
 
308 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  37.46 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  36.63 
 
 
310 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  35.76 
 
 
309 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  34.33 
 
 
311 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  36.51 
 
 
310 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  36.42 
 
 
309 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  36.04 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  36.09 
 
 
309 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  36.09 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  33.98 
 
 
310 aa  179  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  35.33 
 
 
316 aa  178  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  35.55 
 
 
310 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  35.33 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  35.33 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  34.9 
 
 
309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  35.69 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  34.88 
 
 
308 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  35.35 
 
 
311 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  33.88 
 
 
311 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  33.89 
 
 
311 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  35.06 
 
 
306 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  35.06 
 
 
306 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  35.06 
 
 
306 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  35.06 
 
 
306 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  33.89 
 
 
311 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  34.88 
 
 
308 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  34.74 
 
 
306 aa  169  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  33.55 
 
 
311 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  33.77 
 
 
310 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  34.2 
 
 
306 aa  169  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  34.42 
 
 
306 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  34.42 
 
 
306 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  34.09 
 
 
308 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  33.99 
 
 
309 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  33.88 
 
 
306 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  34.8 
 
 
314 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  35.39 
 
 
308 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  36.36 
 
 
308 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  33.9 
 
 
306 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  35.37 
 
 
313 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  34.85 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  34.09 
 
 
306 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  34.09 
 
 
306 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  32.89 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  32.89 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  34.09 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  33.12 
 
 
311 aa  165  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  34.53 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  33.33 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  31.89 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  34.08 
 
 
306 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  32.54 
 
 
314 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  37.29 
 
 
310 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  31.19 
 
 
317 aa  159  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  32.89 
 
 
312 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  32.54 
 
 
314 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  32.54 
 
 
314 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  30.23 
 
 
314 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  31.86 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  32.54 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  32.25 
 
 
313 aa  155  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  32.45 
 
 
324 aa  155  7e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  31.86 
 
 
338 aa  155  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  31.86 
 
 
314 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  31.86 
 
 
314 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  31.86 
 
 
314 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  31.51 
 
 
313 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  31.83 
 
 
307 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  32.43 
 
 
314 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  30.26 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  30.56 
 
 
309 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  31.46 
 
 
314 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  33.11 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2658  CheW protein  32.6 
 
 
333 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2450  CheW protein  32.6 
 
 
333 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.979041  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2543  CheW protein  32.29 
 
 
334 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2554  CheW protein  32.29 
 
 
334 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  32.46 
 
 
317 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  30.69 
 
 
319 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2499  CheW protein  31.97 
 
 
334 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55114  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  31.09 
 
 
324 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  31.83 
 
 
318 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  31.67 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  29.13 
 
 
311 aa  139  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  33.97 
 
 
326 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  30.63 
 
 
321 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  31.96 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2819  putative CheW protein  30.97 
 
 
330 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3396  putative CheW protein  31.23 
 
 
295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  32.25 
 
 
325 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  30.31 
 
 
321 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  33.01 
 
 
317 aa  135  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  30.98 
 
 
308 aa  133  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  30.74 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  29.6 
 
 
316 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  29.6 
 
 
316 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.639433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>