More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1794 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  100 
 
 		 308 aa  627  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  86.69 
 
 		 308 aa  552  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  86.36 
 
 		 308 aa  547  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  76.95 
 
 		 306 aa  494  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  64.17 
 
 		 307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  63.84 
 
 		 306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  63.84 
 
 		 306 aa  401  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  62.87 
 
 		 306 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  61.89 
 
 		 306 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  62.87 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  63.19 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  62.54 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  62.21 
 
 		 306 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  62.21 
 
 		 306 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  62.21 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  61.89 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  61.89 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  61.89 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  61.89 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  61.74 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  59.87 
 
 		 306 aa  378  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  58.15 
 
 		 309 aa  374  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  59.34 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  57.33 
 
 		 309 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  58.22 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  59.34 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  57.89 
 
 		 310 aa  364  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  58.69 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  56.07 
 
 		 316 aa  360  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  57.89 
 
 		 310 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  56.72 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  59.34 
 
 		 309 aa  352  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  58.22 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  58.22 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  58.22 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  57.24 
 
 		 310 aa  335  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  51.3 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  51.15 
 
 		 313 aa  317  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  50 
 
 		 311 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 		 311 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  50 
 
 		 311 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 		 311 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  51.8 
 
 		 309 aa  311  7.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  49.68 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  49.03 
 
 		 308 aa  308  8e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  49.03 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  47.1 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  50.32 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  48.03 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  47.9 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  48.87 
 
 		 312 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  56.28 
 
 		 248 aa  293  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  48.55 
 
 		 317 aa  291  9e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  48.84 
 
 		 314 aa  288  8e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  48.05 
 
 		 314 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  48.05 
 
 		 314 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  47.91 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  47.44 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  47.44 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  47.44 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  47.44 
 
 		 314 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  46.95 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  46.65 
 
 		 338 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  47.27 
 
 		 314 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  47.6 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  47.27 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  47.27 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  46.73 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  46.65 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  45.8 
 
 		 307 aa  275  9e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  46.95 
 
 		 313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  48.04 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  46.23 
 
 		 313 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  46.23 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  43.87 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  47.13 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  37.63 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  37.81 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  35.29 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  35.29 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  36.95 
 
 		 299 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  36.95 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  36.95 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1139  response regulator receiver:CheW-like protein  37.15 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  38.87 
 
 		 295 aa  202  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  37.15 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1323  chemotaxis protein CheV, putative  36.97 
 
 		 314 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  36.84 
 
 		 321 aa  198  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  37.1 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  35.71 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  35.13 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  33.85 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4654  CheW protein  36.36 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  37.81 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  35.76 
 
 		 326 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  36.75 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  36.75 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4384  response regulator receiver modulated CheW protein  37.63 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.234409 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  35.44 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  36.75 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>