More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2032 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  100 
 
 		 338 aa  691    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  82.69 
 
 		 314 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  82.69 
 
 		 314 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  82.69 
 
 		 314 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  83.01 
 
 		 314 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  81.09 
 
 		 314 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  81.09 
 
 		 314 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  81.09 
 
 		 314 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  81.09 
 
 		 314 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  80.45 
 
 		 314 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  79.81 
 
 		 313 aa  514  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  76.92 
 
 		 312 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  76.05 
 
 		 317 aa  502  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  76.92 
 
 		 313 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  75.4 
 
 		 314 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  74.2 
 
 		 314 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  68.05 
 
 		 313 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  67.41 
 
 		 314 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  67.09 
 
 		 313 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  67.73 
 
 		 317 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  62.1 
 
 		 319 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  60.71 
 
 		 311 aa  388  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  59.62 
 
 		 311 aa  388  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  60.71 
 
 		 311 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  60.71 
 
 		 311 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  61.22 
 
 		 308 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  60.71 
 
 		 311 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  60.06 
 
 		 311 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  60.71 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  59.09 
 
 		 310 aa  371  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  53.87 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  55.63 
 
 		 310 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  55.31 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  53.55 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  53.55 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  54.05 
 
 		 310 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  53.23 
 
 		 309 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  53.72 
 
 		 309 aa  331  9e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  53.72 
 
 		 308 aa  328  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  53.72 
 
 		 308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  52.6 
 
 		 306 aa  322  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  52.27 
 
 		 306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  51.95 
 
 		 306 aa  319  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  52.27 
 
 		 306 aa  318  6e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  51.95 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  55.63 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  52.75 
 
 		 316 aa  317  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  51.95 
 
 		 306 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  51.95 
 
 		 306 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  51.95 
 
 		 306 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  51.95 
 
 		 306 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  51.3 
 
 		 306 aa  315  9e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  52.6 
 
 		 306 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  51.95 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  51.78 
 
 		 306 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  51.46 
 
 		 306 aa  305  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 		 306 aa  305  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  50.97 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  50 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  50.5 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  48.23 
 
 		 308 aa  289  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  46.28 
 
 		 310 aa  289  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  50.49 
 
 		 309 aa  288  9e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  47.91 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  49.68 
 
 		 306 aa  286  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  48.1 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  46.79 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  47.19 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  47.08 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  46.65 
 
 		 308 aa  281  9e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  49.05 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  45.19 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  47.78 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  47.78 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  45.02 
 
 		 307 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  39.65 
 
 		 314 aa  215  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  46.15 
 
 		 248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  38.7 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  39.3 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  38.11 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  38.6 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  38.25 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  36.95 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  37.89 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  37.89 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  37.89 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  37.89 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  37.04 
 
 		 320 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  39.44 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  37.26 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  37.26 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  37.13 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  38.14 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  36.84 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  36.84 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  36.84 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2527  CheW-like protein  37.81 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  37.46 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  36.63 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  36.84 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>