More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01327 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  100 
 
 		 319 aa  652    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  67.2 
 
 		 313 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  65.18 
 
 		 314 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  63.01 
 
 		 317 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  63.9 
 
 		 313 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  63.46 
 
 		 314 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  62.62 
 
 		 314 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  62.62 
 
 		 314 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  62.62 
 
 		 314 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  62.62 
 
 		 314 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  63.14 
 
 		 317 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  65.16 
 
 		 313 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  62.9 
 
 		 312 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  62.94 
 
 		 314 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  63.26 
 
 		 314 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  63.26 
 
 		 314 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  62.82 
 
 		 314 aa  411  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  62.1 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  62.06 
 
 		 313 aa  401  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  62.74 
 
 		 314 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  60.97 
 
 		 314 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  57.14 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  55.84 
 
 		 311 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  55.99 
 
 		 311 aa  359  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  54.22 
 
 		 308 aa  355  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  53.9 
 
 		 311 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  53.9 
 
 		 311 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  53.8 
 
 		 311 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  53.9 
 
 		 308 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  53.16 
 
 		 311 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  49.67 
 
 		 309 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  49.51 
 
 		 310 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  49.19 
 
 		 310 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  50.33 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  50.33 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  49.35 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  49.19 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  49.19 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  49.52 
 
 		 316 aa  296  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  48.86 
 
 		 309 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  48.85 
 
 		 309 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  49.03 
 
 		 306 aa  291  7e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  49.03 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  49.03 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  49.03 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  49.03 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  49.03 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  48.7 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  48.7 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  50.65 
 
 		 310 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  48.39 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  48.38 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  48.06 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  45.95 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  47.27 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  48.68 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  48.54 
 
 		 306 aa  279  5e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  48.22 
 
 		 307 aa  278  9e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  46.73 
 
 		 308 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  47.6 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  47.1 
 
 		 310 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  47.57 
 
 		 308 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  47.76 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  45.95 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  47.9 
 
 		 308 aa  271  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  47.4 
 
 		 306 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  46.41 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  43.75 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  42.07 
 
 		 324 aa  256  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  42.32 
 
 		 314 aa  256  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  42.32 
 
 		 314 aa  256  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  40.58 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  43.13 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  42.22 
 
 		 309 aa  242  7e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  41.53 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  46.56 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  35.62 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  35.5 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  35.5 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  34.46 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  34.81 
 
 		 322 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  35.2 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  33.97 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  34.11 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  34.51 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  35.02 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  33.02 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  33.44 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  33.01 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  33.33 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  32.62 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  33.33 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  33.92 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  32.51 
 
 		 299 aa  170  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  33.92 
 
 		 298 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  33.92 
 
 		 298 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  33.92 
 
 		 298 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  32.16 
 
 		 299 aa  169  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  32.72 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  32.25 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>