More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1449 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 		 321 aa  652    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  96.57 
 
 		 321 aa  638    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  79.44 
 
 		 324 aa  521  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  77.5 
 
 		 325 aa  513  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2543  CheW protein  70.75 
 
 		 334 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2554  CheW protein  70.75 
 
 		 334 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2450  CheW protein  70.75 
 
 		 333 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.979041  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2658  CheW protein  70.75 
 
 		 333 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2499  CheW protein  70.44 
 
 		 334 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2819  putative CheW protein  69.5 
 
 		 330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  60.26 
 
 		 316 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  60.26 
 
 		 316 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  60.9 
 
 		 313 aa  374  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  59.06 
 
 		 317 aa  371  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3759  response regulator receiver modulated CheW protein  58.79 
 
 		 323 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00050568  normal  0.01011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1763  putative CheW protein  57.64 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  56.33 
 
 		 318 aa  358  7e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0364  response regulator receiver modulated CheW protein  55.03 
 
 		 317 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  56.27 
 
 		 326 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  55.31 
 
 		 325 aa  348  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  53.77 
 
 		 320 aa  345  5e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  50.99 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  42.33 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  40.13 
 
 		 322 aa  231  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  38.12 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  36.31 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  37.46 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  36.31 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  36.84 
 
 		 308 aa  198  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  36.86 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  35.19 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  36.88 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  36.88 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  36.56 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  36.01 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  35.69 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  34.88 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  36.86 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  34.91 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  34.95 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  35.31 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  35.31 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  35.31 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  35.6 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  35.31 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  33.65 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  35.31 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  35.31 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  34.29 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  34.26 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  34.82 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  33.75 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  33.75 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  33.75 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  34.82 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  35.14 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  34.07 
 
 		 313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  33.44 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  35 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  32.2 
 
 		 313 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  36.19 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  33.44 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  33.13 
 
 		 314 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  35.31 
 
 		 306 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  34.82 
 
 		 311 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  34.69 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  34.69 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  35.62 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  34.45 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  34.69 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  33.77 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  33.02 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  32.31 
 
 		 314 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  32.31 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  32.31 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  34.38 
 
 		 317 aa  179  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  34.67 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  33.65 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  33.65 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  34.06 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  33.01 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  33.75 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  34.91 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  32.18 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  34.15 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  32.1 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  31.75 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  34.14 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  32.1 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  32.1 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  33.64 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  31.75 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  31.17 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  30.96 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  31.75 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  32.14 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  31.83 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  32.14 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  29.75 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  31.27 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>