More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1431 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 		 313 aa  637    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  51.97 
 
 		 309 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  51.32 
 
 		 306 aa  319  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  51.15 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  51.82 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  51.8 
 
 		 306 aa  316  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  50.49 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  50.82 
 
 		 308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  51.16 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  51.82 
 
 		 310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  51.49 
 
 		 310 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  50.16 
 
 		 311 aa  311  5.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  51.49 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 		 307 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  51.99 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  50.5 
 
 		 306 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  48.03 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  50 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  50.99 
 
 		 306 aa  309  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  50.66 
 
 		 309 aa  308  5e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  52.67 
 
 		 308 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  49.67 
 
 		 306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  50.83 
 
 		 306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  50.83 
 
 		 306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  52.67 
 
 		 308 aa  308  8e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  50.83 
 
 		 306 aa  308  8e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  50.66 
 
 		 306 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  50.17 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  50.17 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  50.17 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  50.17 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  52.15 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  54.28 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  49.34 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  52.15 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  49.67 
 
 		 310 aa  305  7e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  51.82 
 
 		 309 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  49.5 
 
 		 306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  49.68 
 
 		 312 aa  299  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  47.35 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  48.86 
 
 		 308 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  49.67 
 
 		 309 aa  295  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  47.23 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  47.68 
 
 		 311 aa  292  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  47.35 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  47.02 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  47.02 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  47.02 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  48.21 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  46.91 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  46.3 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  47.56 
 
 		 314 aa  286  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  47.08 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  46.71 
 
 		 311 aa  285  9e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  44.59 
 
 		 314 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  44.59 
 
 		 314 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  44.59 
 
 		 314 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  45.95 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  44.63 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  44.59 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  46.91 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  45.16 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  46.89 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  46.89 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  45.63 
 
 		 312 aa  279  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  45.48 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  44.84 
 
 		 314 aa  275  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  44.66 
 
 		 314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  44.66 
 
 		 314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  44.66 
 
 		 314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  43.63 
 
 		 314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  44.34 
 
 		 314 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  47.83 
 
 		 307 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  47.42 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  46.25 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  50.2 
 
 		 248 aa  254  9e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  40.82 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  40.95 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  40.95 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  41.46 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  39.88 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  37.83 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  38.61 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  39.62 
 
 		 317 aa  203  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  39.56 
 
 		 318 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  36.45 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  37.78 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  37.46 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  39.74 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  35.05 
 
 		 314 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3759  response regulator receiver modulated CheW protein  37.3 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00050568  normal  0.01011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  35.81 
 
 		 324 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  35.54 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  36.42 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  37.63 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  33.22 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0364  response regulator receiver modulated CheW protein  36.59 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0629  response regulator receiver modulated CheW protein  34.98 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1763  putative CheW protein  36.08 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2364  response regulator receiver modulated CheW protein  36.99 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>