More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06152 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  100 
 
 		 314 aa  623  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  100 
 
 		 314 aa  623  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  86.31 
 
 		 314 aa  541  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  48.53 
 
 		 308 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  48.21 
 
 		 308 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  51.13 
 
 		 310 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  50.96 
 
 		 310 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  47.57 
 
 		 309 aa  296  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  48.87 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  47.9 
 
 		 310 aa  291  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  49.83 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  49.33 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  49.04 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  49.16 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  49.16 
 
 		 306 aa  285  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  48.05 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  49.33 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  49.33 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  49.16 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  49.33 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  49.33 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  47.99 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  49.16 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  49.35 
 
 		 308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  46.93 
 
 		 309 aa  282  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  48.82 
 
 		 306 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  48.21 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  46.95 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  48.38 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  47.99 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  48.39 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  46.89 
 
 		 313 aa  280  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  48.22 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  48.22 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  46.98 
 
 		 306 aa  278  6e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  47.14 
 
 		 306 aa  278  7e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  50 
 
 		 311 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  48.17 
 
 		 306 aa  277  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  47.16 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  49.51 
 
 		 310 aa  275  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  48.32 
 
 		 306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  48.23 
 
 		 308 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  47.91 
 
 		 308 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  49.2 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  48.74 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  48.74 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  45.4 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  49.2 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  45.37 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  47.78 
 
 		 338 aa  269  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  46.75 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  46.96 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  45.28 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  45.83 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  45.69 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  45.66 
 
 		 313 aa  258  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  45.86 
 
 		 314 aa  258  9e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  45.79 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  45.28 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  44.51 
 
 		 314 aa  256  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  42.32 
 
 		 319 aa  256  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  44.87 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  44.97 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  44.03 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  44.03 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  44.03 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  44.03 
 
 		 314 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  44.55 
 
 		 314 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  43.41 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  43.73 
 
 		 313 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  45.21 
 
 		 307 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  43.41 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  43.73 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  44.98 
 
 		 309 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  46.3 
 
 		 314 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  44.05 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  39.02 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  40.07 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  36.05 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  38.75 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  38.04 
 
 		 322 aa  192  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  38.11 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  36.91 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  36.91 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  37.14 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  35.08 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  37.7 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2364  response regulator receiver modulated CheW protein  35.14 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  38.14 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  36.24 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  38.82 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  38.82 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1323  chemotaxis protein CheV, putative  37.62 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  35.17 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  35.17 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  35.17 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  38.03 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1139  response regulator receiver:CheW-like protein  38.18 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  34.48 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  37.79 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>