More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2320 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  100 
 
 		 306 aa  625  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  90.52 
 
 		 306 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  90.52 
 
 		 306 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  90.85 
 
 		 306 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  90.52 
 
 		 306 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  90.85 
 
 		 306 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  90.2 
 
 		 306 aa  567  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  89.54 
 
 		 306 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  89.54 
 
 		 306 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  89.54 
 
 		 306 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  89.54 
 
 		 306 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  88.89 
 
 		 306 aa  558  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  86.6 
 
 		 306 aa  550  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  86.93 
 
 		 306 aa  551  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  86.6 
 
 		 306 aa  548  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  85.62 
 
 		 307 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  65.46 
 
 		 306 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  66.01 
 
 		 306 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  63.75 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  63.64 
 
 		 309 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  61.61 
 
 		 316 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  62.01 
 
 		 308 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  61.74 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  61 
 
 		 310 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  59.6 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  60.33 
 
 		 310 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  58.8 
 
 		 308 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  58.22 
 
 		 309 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  58.8 
 
 		 308 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  57.33 
 
 		 310 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  58.94 
 
 		 309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  58.94 
 
 		 309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  58.94 
 
 		 309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  59.27 
 
 		 309 aa  352  5.9999999999999994e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  59 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  53.62 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  51.63 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  50.98 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  50.65 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  64.61 
 
 		 248 aa  323  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  50.81 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  50.33 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  50.33 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  50.65 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  50.33 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  49.35 
 
 		 311 aa  317  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  50.33 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  48.7 
 
 		 312 aa  315  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  52.6 
 
 		 338 aa  315  8e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  50.99 
 
 		 313 aa  309  4e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  50.97 
 
 		 317 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  50.32 
 
 		 314 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  51.64 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 		 314 aa  300  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  49.35 
 
 		 314 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  49.35 
 
 		 314 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  49.35 
 
 		 314 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  49.35 
 
 		 314 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  50.65 
 
 		 313 aa  295  4e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  50.32 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  49.03 
 
 		 314 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  48.7 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  49.65 
 
 		 307 aa  289  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  49.19 
 
 		 314 aa  288  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  47.73 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  48.39 
 
 		 314 aa  285  7e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  48.54 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  48.22 
 
 		 317 aa  279  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  48.48 
 
 		 314 aa  276  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  47.6 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  48.32 
 
 		 314 aa  275  9e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  48.32 
 
 		 314 aa  275  9e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  45.13 
 
 		 324 aa  266  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  47.4 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1139  response regulator receiver:CheW-like protein  39.36 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1323  chemotaxis protein CheV, putative  38.65 
 
 		 314 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  38.54 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4654  CheW protein  39.58 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  41.55 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  39.66 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  39.5 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  39.5 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  39.5 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  39.93 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  39.15 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  38.89 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  36.59 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  39.31 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  39.15 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  38.54 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  38.54 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  38.06 
 
 		 313 aa  205  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  39.65 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  38.43 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  38.02 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0498  putative chemotaxis protein, CheW-like  39.5 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.857231  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0364  response regulator receiver modulated CheW protein  37.27 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  37.19 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>