74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2129 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2129  CheW protein  100 
 
 
148 aa  293  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0995  putative CheW protein  37.12 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3197  CheW protein  33.1 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.37318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  36.89 
 
 
475 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  28.17 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.73 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  28.37 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  41.67 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  28.37 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  26.85 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  43.75 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  26.85 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  43.75 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  24.24 
 
 
139 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  31.43 
 
 
212 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.67 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1760  CheW protein  31 
 
 
875 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  34.78 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  26.4 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4120  CheW protein  28.18 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000127849  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  23.33 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  26.98 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  27.21 
 
 
189 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  31.47 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  26.09 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1325  CheW protein  29.01 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  24.11 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  25 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  32.35 
 
 
212 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  32.61 
 
 
164 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  30.28 
 
 
164 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  32.29 
 
 
518 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  30.2 
 
 
164 aa  42.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2361  CheW protein  30.77 
 
 
342 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  29.52 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  29.33 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  31.52 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  29.33 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  26.67 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28.85 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.63 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  29.33 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.33 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  35.96 
 
 
212 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  29.33 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  29.33 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  29.33 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  34.21 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  29.33 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  24.14 
 
 
170 aa  41.2  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  28.67 
 
 
164 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  29.79 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  27.62 
 
 
324 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  32.11 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  27.86 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  27.27 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  29.9 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  29.9 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.48 
 
 
159 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  31.48 
 
 
159 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  29.52 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  31.48 
 
 
159 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  23.53 
 
 
167 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  28.57 
 
 
520 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  25.83 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  31.48 
 
 
159 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  29.9 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  28.3 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  29.9 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  27.45 
 
 
314 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  28 
 
 
326 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  30.82 
 
 
164 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  30.82 
 
 
164 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  32.77 
 
 
147 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>