82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0671 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  100 
 
 		 180 aa  361  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  74.18 
 
 		 182 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  57.22 
 
 		 181 aa  200  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  57.22 
 
 		 181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  53.85 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  36.9 
 
 		 170 aa  115  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  38.18 
 
 		 168 aa  110  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  37.7 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  32.57 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  32.78 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  35.2 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  34.5 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  31.33 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  33.33 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  33.14 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  32.56 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  32.96 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  33.33 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  31.03 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  29.28 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  26.53 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  31.21 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  39.29 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  29.08 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  28.9 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  28.9 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  31.2 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  29.79 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  26.03 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  30.4 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  29.79 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  29.79 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  26.21 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  28.16 
 
 		 153 aa  51.2  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  29.32 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  26.97 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  27.43 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  25.62 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  28.06 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  30.86 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  28.42 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  23.86 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  26.15 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  32.04 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  30.34 
 
 		 515 aa  45.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  30.34 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  25.78 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  30.14 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  21.93 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  28.41 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  35.16 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  25.71 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  23.85 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  27.1 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  27.1 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3334  CheW protein  35.53 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  25.71 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  26.92 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.56 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  25 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  30.39 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.56 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.56 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  24.79 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  25.35 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  26.72 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  28.04 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  35.06 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  25.74 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  21.35 
 
 		 478 aa  41.6  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  28.79 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  30.34 
 
 		 191 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  26.45 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  27.05 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  22.86 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  33.33 
 
 		 779 aa  41.2  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  22.76 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  30.34 
 
 		 191 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  27.62 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.57 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  27.21 
 
 		 169 aa  40.8  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  25.84 
 
 		 200 aa  40.8  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>