38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3352 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  76.7 
 
 		 176 aa  283  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  59.89 
 
 		 177 aa  211  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  59.32 
 
 		 175 aa  207  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  56.25 
 
 		 176 aa  204  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  55.68 
 
 		 175 aa  198  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  56.5 
 
 		 175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  55.93 
 
 		 175 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  54.24 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  47.7 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  52.27 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  35.59 
 
 		 175 aa  95.1  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  32.58 
 
 		 170 aa  92  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  35.63 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  28.16 
 
 		 181 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  27.43 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  28.74 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  30.9 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  31.03 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  29.55 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  35.09 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  29.17 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  30.07 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  30.07 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  28.97 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  28.28 
 
 		 168 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  28.28 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  31.43 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  24.85 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  26.76 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  25.2 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  32.91 
 
 		 528 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3334  CheW protein  33.33 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  27.14 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  28.74 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  27.43 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  24.36 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  26.71 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>