62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0670 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  100 
 
 		 181 aa  363  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  83.89 
 
 		 181 aa  305  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  83.89 
 
 		 181 aa  305  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  56.91 
 
 		 182 aa  184  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  53.85 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  43.45 
 
 		 168 aa  127  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  36.93 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  38.37 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  36.99 
 
 		 175 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  36.99 
 
 		 175 aa  104  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  37.57 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  33.71 
 
 		 176 aa  97.4  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  35.26 
 
 		 175 aa  94.4  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  35.09 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  29.89 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  32 
 
 		 175 aa  84.3  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  34.09 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  28.74 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  32.54 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  34.66 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  26.24 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  29.58 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  26.28 
 
 		 179 aa  51.2  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  30.61 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  31.29 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  33.33 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  31.29 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  25.87 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  25.97 
 
 		 779 aa  48.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  22.92 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  31.37 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  31.37 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  24.6 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  30.53 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  25.2 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  25.21 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  29.79 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  34.09 
 
 		 181 aa  44.3  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  27.59 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.6 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  25.21 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  29.01 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  29.79 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3334  CheW protein  36.07 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  26.05 
 
 		 515 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  34.07 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  25.93 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  25.71 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  25.23 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  23.08 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  29.51 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  25.93 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  27.06 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  23.53 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  22.45 
 
 		 140 aa  42  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  30 
 
 		 200 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  26.42 
 
 		 154 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  29.21 
 
 		 192 aa  41.2  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  22.92 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  31.07 
 
 		 161 aa  41.2  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  21.88 
 
 		 155 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  21.88 
 
 		 155 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>